РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК
СИБИРСКОЕ ОТДЕЛЕНИЕ
ЖУРНАЛ
СТРУКТУРНОЙ
ХИМИИ
НАУЧНЫЙ ЖУРНАЛ
Основан в 1960 г.
Т О М 58
Февраль-март
Выходит 8 раз в год
№ 2, 2017
СТРОЕНИЕ БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНЫХ СОЕДИНЕНИЙ
С О Д Е Р Ж А Н И Е
ТЕОРИЯ СТРОЕНИЯ МОЛЕКУЛ И ХИМИЧЕСКОЙ СВЯЗИ
Нечаева Л.С., Бутырская Е.В.,
Запрягаев С.А.
Компьютерное моделирование
сорбции аминокислот
на углеродных нанотрубках
Ключевые слова: углеродная нанотрубка, глицин,
аланин, фенилаланин, компьютерное моделирование,
энергия адсорбции
Тен Г.Н., Глухова О.Е., Слепченков М.М.,
Щербакова Н.Е., Баранов В.И.
Теоретическое исследование механизма
таутомерного превращения
в димере 7-азаиндола и комплексе
7-азаиндола с молекулой воды методами
оптической спектроскопии
Ключевые слова: 7-азаиндол, комплекс с водой,
димер, таутомер, электронные спектры,
низкочастотные колебания, спектры флуоресценции
Фёдоров М.С., Гиричева Н.И.
Проявление гош-эффекта в конформерах
гидразида бензолсульфоновой кислоты
Ключевые слова: ароматические сульфонилгидразиды,
гидразид бензолсульфоновой кислоты, конформеры,
NBO анализ, квантово-химические расчеты,
гош-эффект, аномерный эффект
Khaleghi-Rad A., Beyramabadi S.A., Morsali A.,
Ebrahimi M., Khorasandi-Chenarboo M.
Tautomerism of the antiepileptic drug Felbamate:
A DFT study
Keywords: Felbamate, Taloxa, DFT, PCM,
tautomerism, intramolecular proton transfer
ИЗДАТЕЛЬСТВО СО РАН
НОВОСИБИРСК
2017
261
253
242
233
Стр.1
ИССЛЕДОВАНИЕ СТРОЕНИЯ МОЛЕКУЛ ФИЗИЧЕСКИМИ МЕТОДАМИ
Tezcan H., Tokay N.
Structural and spectral properties
of 3-substitutedphenyl-1,5-diphenylformazans:
A quantum chemical study
Keywords: formazans, substituent effects,
UV-vis spectra, TD-DFT, PCM
Pacheco A.G., Salgado-Morán G., Gerli-Candia L. ,
Ramírez-Tagle R., Glossman-Mitnik D., Misra A.,
De Carvalho Alcântara A.F.
Theoretical investigation of the molecular structure
and spectroscopic properties of oxicams
Keywords: nonsteroidal anti-inflammatory drugs,
chemical properties, spectroscopic analysis,
density functional theory
СТРУКТУРА ЖИДКОСТЕЙ И РАСТВОРОВ
Аникеенко А.В., Зеликман М.В., Кадцын Е.Д.,
Медведев Н.Н.
Моделирование ассоциатов глицирризиновой
кислоты с холестерином в метаноле
Ключевые слова: молекулярно-динамическое
моделирование, водные растворы,
глицирризиновая кислота, холестерин, метанол,
структура ассоциатов
Гамов Г.А., Александрийский В.В.,
Шарнин В.А.
Строение сольватов пиридоксина
в водном растворе по данным
квантовохимических расчетов
и спектроскопии ЯМР
Ключевые слова: пиридоксин, DFT, ЯМР,
сольватация, таутомерное равновесие
КРИСТАЛЛОХИМИЯ
Миронова Е.В., Криволапов Д.Б., Литвинов И.А.,
Мустакимова Л.В., Мамедов В.А.
Структура новых производных
пергидропиримидин-2-онов
и межмолекулярные взаимодействия
в их кристаллах
Ключевые слова: пергидропиримидин-2-оны,
кристаллическая и молекулярная структура,
рентгеноструктурный анализ
Адизов Ш.М., Ташходжаев Б., Кунафиев Р.Ж.,
Мирзаева М.М., Юлдашев П.Х.
Кристаллическая структура псевдокопсинина
и его солей
Ключевые слова: индолиновые алкалоиды,
псевдокопсинин, галоидные соли, РСА
308
300
293
285
278
269
Стр.2
Ahmad M., Perveen Z., Bortoluzzi A.J., Hameed S.,
Shah M.R., Tariq M., ud Din G., Anwar M.
Structural diversities and preliminary
antimicrobial studies
of 1-((E)-(pentylimino)methyl)naphthalen-2-ol
and its metal complexes
Keywords: 2-hydroxynaphthaldehyde, n-amyl amine,
zwitterions, octahedral, centrosymmetric square planar,
antimicrobial
СУПРАМОЛЕКУЛЯРНЫЕ И НАНОРАЗМЕРНЫЕ СИСТЕМЫ
Yakalı G., Öztürk S.E., Aygün M.
Strong hydrogen bonded supramolecular
architecture in a crystal of the {3-[2-(1,3-benzodioxol5-yl)-7-methoxy-1-benzofuran-5-yl]
propyl}
diethylamine cation with the hydrogen bonded
chloride hydrate anion (halides) assembly:
X-ray structure analysis, DFT calculations,
Hirshfeld surface analysis
Keywords: crystal structure, benzofuran, bifurcate hydrogen
bond, chloride hydrate, supramolecular architecture, tetramers,
halides, DFT, Hirsfeld surface analysis
ОБ ЗОРЫ
Курусь Н.Н., Дульцев Ф. Н.
Измерение силы раcкручивания
двойной спирали ДНК
Ключевые слова: межмолекулярные силы,
кварцевый резонатор, олигонуклеотиды,
комплементарность,
атомно-силовая микроскопия
КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ
Митин А.В.
Взаимная поляризация аминокислот
в малом тетра-гем цитохроме с 1M1P
Ключевые слова: неэмпирический расчет,
приближение ЛКАО, метод Хартри–Фока,
молекулярные орбитали, анализ заселенности
Mahani M., Sheikhghomi S., Sheikhghomi H., Fasihi J.
Quantitative structure activity relationship
study on binding affinity of some
aminothiazole derivatives with dopamine
receptor in brain
Keywords: QSAR, partial least squares, soft modelling,
structural descriptors, aminothiazole derivatives,
dopamine receptor
361
357
332
321
314
Стр.3
Zha G.-J.
Spin-forbidden CO binding to iron–sulfur
cluster-free hydrogenase:
A density functional study
Keywords: density functional theory, PHmd–CO,
cluster-free hydrogenase
Шматко Н.Ю., Корчагин Д.В., Шилов Г.В.,
Санина Н.А., Алдошин С.М.
Молекулярная и кристаллическая структура
катионного динитрозильного комплекса железа
с 1,3-диметилтиомочевиной
Ключевые слова: оксид азота (NO),
динитрозильные комплексы железа,
1,3-диметилтиомочевина, РСА
Слывка Ю.И.
Кристаллическая структура
-комплекса AgClO4
с 2-амино-5-аллилтио-1,3,4-тиадиазолом
состава [Ag(C5H7N3S2)(ClO4)]
Ключевые слова: синтез, серебро(I), π-комплекс,
1,3,4-тиадиазол, кристаллическая структура
Попов Л.Д., Бородкин С.А., Ткачёв В.В.,
Туполова Ю.П., Бурлов А.С., Шилов Г.В.,
Утенышев А.Н.
Кристаллическая структура 2-метил-3{[3-метил-5-оксо-1-фенилпиразол-4-илиденметил]амино}-хиназолин-4-оната
меди(II)
Ключевые слова: рентгеноструктурный анализ,
комплекс меди(II), кристаллическая структура
Миронова Е.В., Криволапов Д.Б., Литвинов И.А.,
Мустакимова Л.В., Мамедов В.А.
Молекулярная и кристаллическая структура
4-дихлорметилен-5-бензоил-6-фенилпергидропиримидин-2-она
и
его N(1)-замещенного аналога
Ключевые слова: 2(1H)-пиримидиноны,
дегидратация пиримидинонов,
рентгеноструктурный анализ,
молекулярная и кристаллическая структура
Попов Л.Д., Бородкин С.А., Туполова Ю.П.,
Левченков С.И., Ткачёв В.В., Бурлов А.С.,
Цатурян А.А.
Молекулярная и кристаллическая структура
нового основания Шиффа:
4-метил-N-[2-[(2-метил-4-оксо-4ан-хиназолин-3ил)иминометил]фенил]бензолсульфонамида
Ключевые
слова: основание Шиффа,
рентгеноструктурный анализ, ЯМР,
кристаллическая структура, молекулярное строение
383
379
375
373
370
366
Стр.4
Jothi L., Anuradha G., Vasuki G., Ramesh Babu R.,
Ramamurthi K.
Crystal structure
of N-(p-methylbenzylidene)-p-bromoaniline
Keywords: synthesis, crystal structure, benzylidene, aniline,
hydrogen bonding
МАТЕРИАЛЫ XVI I СИМПОЗИУМА
ПО МЕЖМОЛЕКУЛЯРНОМУ В ЗАИМОДЕЙСТВИЮ
И КОНФОРМАЦИЯМ МОЛЕКУЛ, ПОСВЯЩЕННОГО 1 0 0 -ЛЕТИЮ
СО ДНЯ РОЖДЕНИЯ А.И. КИТАЙГОРОДСКОГО
Р о с с и я , Пущи н о , 23 – 2 7 июн я 2 0 1 4 г .
Гринёва О.В.
Кристаллохимический анализ алифатических
,-диолов: возможности подходов
А.И. Китайгородского и их развитие
Ключевые слова: метод атом-атомных потенциалов,
межмолекулярные взаимодействия, энергия кристалла,
энергетическое координационное число, полиморфы,
конформации, симметрия молекул в кристаллах,
водородные связи,
Кембриджский банк структурных данных
Богдан Т.В., Алексеев Е.С.
Роль консервативной межспиральной
водородной связи Ser74–Trp158 в сайте
связывания холестерина в конформационной
стабильности β2-адренорецептора
(молекулярно-динамическое моделирование)
Ключевые слова: β2-адренорецептор,
межспиральная водородная связь Ser74 – Trp158,
мутация S74A, молекулярно-динамическое моделирование
Пастон С.В., Николаев А.И., Ушков П.А.
Комплексы ЭДТА, тимидина и ионов Cu2+
по данным масс-спектрометрии
Ключевые слова: азотистые основания ДНК,
ионы меди(II), ЭДТА, хелатные комплексы,
масс-спектрометрия, электроспрей
Пастон С.В., Поляничко А.М., Шуленина О.В.
Исследование взаимодействия ДНК
с ионами Cu2+ и Mg2+
в присутствии кофеина
Ключевые слова: ДНК, кофеин, ионы металлов,
УФ поглощение, круговой дихроизм, ИК спектроскопия,
вторичная структура ДНК
Касьяненко Н.А., Qiushi Z., Варшавский М.С.,
Бакулев В.М., Демидов В.Н.
Металлокомплексы ДНК и металлизация
макромолекулы в растворе
Ключевые слова: ДНК,
наночастицы и люминесцирующие нанокластеры серебра,
Ag(Phen)2NO3, цис-ДДП
424
417
410
402
390
387
Стр.5
Унксов И.Н., Касьяненко Н.А.
Конформационные изменения молекулы ДНК
в растворе, вызванные связыванием
светочувствительного катионного ПАВ
Ключевые слова: фотоиндуцированная компактизация
ДНК в комплексе с ПАВ, персистентная длина ДНК,
транс–цис- изомеризация азобензольной группы
Морозова Е.А., Линькова Н.С., Хавинсон В.Х.,
Cоловьёв А.Ю., Касьяненко Н.А.
Взаимодействие пептида AEDL с ДНК in vitro
Ключевые слова: тетрапептид AEDL,
бронхиальный эпителий, ДНК-пептидные взаимодействия,
круговой дихроизм, вискозиметрия
Содержание следующего номера — в конце журнала
438
431
© Сибирское отделение РАН, 2017
© Институт неорганической химии
им. А.В. Николаева СО РАН, 2017
Стр.6