Национальный цифровой ресурс Руконт - межотраслевая электронная библиотека (ЭБС) на базе технологии Контекстум (всего произведений: 610280)
Контекстум
Вопросы вирусологии  / №2 2016

УНИФИКАЦИЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА (250,00 руб.)

0   0
Первый авторКовалев
АвторыМухачева Т.А.
Страниц7
ID391665
АннотацияПрименение молекулярно-генетических методов и подходов в эпидемиологических исследованиях стало настоящим прорывом в понимании закономерностей, путей и механизмов распространения возбудителей инфекций. Однако отсутствие стандартных методов исследования приводит к несопоставимости форматов полученных результатов. В целях унификации методов предлагается выбрать один фрагмент вирусного генома, секвенирование которого было бы необходимым и достаточным условием для проведения молекулярно-эпидемиологических исследований клещевого энцефалита (КЭ). Кандидатом на эту роль может быть фрагмент гена Е длиной 454 нуклеотидов, представленный наибольшим количеством последовательностей в базе данных GenBank. Кроме того, на основе кодируемой этим фрагментом аминокислотной последовательности была разработана система дифференциации вируса КЭ (ВКЭ) на структурные единицы – кластероны (Kovalev S., Mukhacheva T., 2013). На примере природных очагов Среднего Урала была показана информативность кластеронного подхода к изучению генетической структуры популяции ВКЭ-Сиб. Каждый очаг КЭ оказался уникальным как по количественному, так и по качественному составу кластеронов. При этом наибольшее их разнообразие наблюдалось на юге Среднего Урала в зоне Транссибирского пути, что отражает историю колонизации этой территории, тесным образом связанную с дорогами из Сибири в европейскую часть России. Было выявлено три кластерона возрастом не более 50 лет, присутствие которых может свидетельствовать об активном эволюционном процессе в популяциях ВКЭ-Сиб. В свою очередь тип их территориального распределения указывает на решающую роль антропогенного фактора в распространении ВКЭ (Kovalev S., Mukhacheva T., 2014). Кластеронный подход позволяет учесть не только генетическую, но и фенотипическую изменчивость вируса и должен рассматриваться скорее в качестве дополнения, а не альтернативы филогенетическому анализу. Помимо научного, предлагаемый подход может иметь и прикладное значение, например использоваться региональными службами Роспотребнадзора для эпидемиологического мониторинга КЭ. Унификация исследований на основе одного стандартного генетического маркера позволит объединить усилия исследователей из разных регионов России и других стран в изучении КЭ.
УДК616.831-002-022:578.833.26]:577.21.083
Ковалев, С.Ю. УНИФИКАЦИЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА / С.Ю. Ковалев, Т.А. Мухачева // Вопросы вирусологии .— 2016 .— №2 .— С. 43-49 .— URL: https://rucont.ru/efd/391665 (дата обращения: 03.04.2025)

Предпросмотр (выдержки из произведения)

УНИФИкаЦИЯ МОЛЕкУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСкИХ ИССЛЕДОВаНИЙ кЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФаЛИТа ФГАОУ ВПО «Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б.Н. <...> Однако отсутствие стандартных методов исследования приводит к несопоставимости форматов полученных результатов. в целях унификации методов предлагается выбрать один фрагмент вирусного генома, секвенирование которого было бы необходимым и достаточным условием для проведения молекулярно-эпидемиологических исследований клещевого энцефалита (КЭ). <...> Кандидатом на эту роль может быть фрагмент гена Е длиной 454 нуклеотидов, представленный наибольшим количеством последовательностей в базе данных genBank. <...> Кроме того, на основе кодируемой этим фрагментом аминокислотной последовательности была разработана система дифференциации вируса КЭ (вКЭ) на структурные единицы – кластероны (Kovalev s., Mukhacheva T., 2013). на примере природных очагов Среднего Урала была показана информативность кластеронного подхода к изучению генетической структуры популяции вКЭ-Сиб. <...> Каждый очаг КЭ оказался уникальным как по количественному, так и по качественному составу кластеронов. <...> При этом наибольшее их разнообразие наблюдалось на юге Среднего Урала в зоне Транссибирского пути, что отражает историю колонизации этой территории, тесным образом связанную с дорогами из Сибири в европейскую часть России. было выявлено три кластерона возрастом не более 50 лет, присутствие которых может свидетельствовать об активном эволюционном процессе в популяциях вКЭ-Сиб. в свою очередь тип их территориального распределения указывает на решающую роль антропогенного фактора в распространении вКЭ (Kovalev s., Mukhacheva T., 2014). <...> Кластеронный подход позволяет учесть не только генетическую, но и фенотипическую изменчивость вируса и должен рассматриваться скорее в качестве дополнения, а не альтернативы филогенетическому анализу. <...> Помимо научного, предлагаемый подход может иметь и прикладное <...>