Иллюстрации к статье «Экологический сценарий видообразования микроба чумы Yersinia pestis
как основа адекватной молекулярной эволюционной модели» (автор: В.В. Сунцов) (с. 809–818)
Illustrations for the article “Ecological scenario of the plague microbe Yersinia pestis speciation underlying adequate
molecular evolutionary model” (author: Suntsov V.V.) (pp. 809–818)
Рисунок 1. Типичная молекулярная
филогенетическая дендрограмма Yersinia
pestis, созданная на основе анализа
молекулярных SNP-маркеров [16]
Figure 1. A typical molecular phylogenetic dendrogram
of Yersinia pestis based on the molecular SNP marker
analysis [16]
Примечание. MRCA (most recent common ancestor) —
абстрактный наиболее современный статистически
обоснованный предок вида Y. pestis. N07 — узел
политомии (branches 1–4), возникший перед началом
2-й пандемии чумы («Черная смерть»). Овалом выделены
«полевковые» геноварианты 0.PE (подвиды) возбудителя
чумы, образовавшие зону наиболее древних природных
очагов в Евразии.
Note. MRCA (most recent common ancestor) is a putative
most recent statistically justified ancestor of the species
Y. pestis. N07 is a polytomy node (branches 1–4) that arose
before the onset of the second plague pandemic (the “Black
Death”). The oval highlights the “vole” genovariantes 0.PE
(subspecies) of the plague causative agent, which formed
the zone of most ancient natural foci in Eurasia.
Рисунок 2. Тритопное происхождение трех
геновариантов (подвидов) чумного микроба
Yersinia pestis 2.ANT3, 3.ANT2 и 4.ANT1
в трех географических популяциях
монгольского сурка Marmota sibirica sibirica (I),
M. sibirica caliginosus (II) и M. sibirica ssp. (III)
и три самостоятельных маршрута их
территориальной экспансии
Figure 2. The tritopic origin of the three geneovariantes
(subspecies) for the plague microbe Yersinia pestis
2.ANT3, 3.ANT2 and 4.ANT1 in the three geographic
populations of the Mongolian marmot Marmota sibirica
sibirica (I), M. sibirica caliginosus (II) and M. sibirica
ssp. (III) and three independent routes of relevant
territorial expansion
Примечание. Пунктирная линия очерчивает южную
границу зоны глубокого промерзания грунта.
Note. Dottedline outlines the southern boundary of the zone
of soil deep freezing.
Стр.2
СЕВЕРО-ЗАПАДНОЕ ОТДЕЛЕНИЕ МЕДИЦИНСКИХ НАУК
САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКИЙ НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ
ЭПИДЕМИОЛОГИИ И МИКРОБИОЛОГИИ ИМЕНИ ПАСТЕРА
САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКОЕ РЕГИОНАЛЬНОЕ ОТДЕЛЕНИЕ РОССИЙСКОЙ АССОЦИАЦИИ АЛЛЕРГОЛОГОВ
И КЛИНИЧЕСКИХ ИММУНОЛОГОВ (СПб РО РААКИ)
ИНФЕКЦИЯ
и
ИММУНИТЕТ
сентябрь–октябрь
2022, том 12
Журнал издается при участии Отделения Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов,
микробиологов и паразитологов по Санкт-Петербургу и Ленинградской области
№ 5
Главный редактор
Тотолян Арег А. д.м.н., профессор, академик РАН, директор Санкт-Петербургского НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера,
зав. лабораторией молекулярной иммунологии, Санкт-Петербург, Россия
Заместитель главного редактора
Мокроусов И.В. д.б.н., зав. лабораторией молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики Санкт-Петербургского НИИ эпидемиологии
и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия
Редакционная коллегия
Апт А.С.
Барбеито Л.
Брей П.
Гинцбург А.Л.
Лобзин Ю.В.
Лоузир Э.
Львов Д.К.
Маеда К.
Михайлов М.И.
Найденски Х.
Онищенко Г.Г.
д.б.н., профессор, зав. лабораторией иммуногенетики Центрального НИИ туберкулеза, Москва, Россия
д.м.н., профессор, зав. лабораторией нейродегенерации Института Пастера, Монтевидео, Уругвай
д.б.н., профессор, зав. лабораторией медицинской энтомологии и биологии переносчиков болезней Института Пастера в Лаосе,
Вьентьян, Лаос
д.м.н., профессор, академик РАН, директор ФНИЦ эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи МЗ РФ,
Москва, Россия
Лаврентьева И.Н. д.м.н., зав. лабораторией экспериментальной вирусологии Санкт-Петербургского НИИ эпидемиологии и микробиологии
имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия
д.м.н., профессор, академик РАН, научный руководитель ФГБУ Детский научно-клинический центр инфекционных болезней ФМБА,
Санкт-Петербург, Россия
профессор, президент Института Пастера Туниса, Тунис
д.м.н., профессор, академик РАН, НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского ФНИЦ эпидемиологии и микробиологии
имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи МЗ РФ, Москва, Россия
д.вет.н., профессор, директор Национального института инфекционных заболеваний, Токио, Япония
Медуницын Н.В. д.м.н., профессор, академик РАН, заслуженный деятель науки РФ, главный научный сотрудник Научного центра экспертизы
средств медицинского применения, Москва, Россия
д.м.н., профессор, член-корреспондент РАН, зав. лабораторией вирусных гепатитов НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова,
зав. кафедрой микробиологии и вирусологии Российского университета дружбы народов, Москва, Россия
д.м.н., профессор, зав. отделом инфекционной микробиологии Института микробиологии им. Стефана Ангелоффа,
София, Болгария
д.м.н., профессор, академик РАН, зам. председателя Российской академии образования, Москва, Россия
Покровский В.В. д.м.н., профессор, академик РАН, руководитель Федерального НМЦ по профилактике и борьбе со СПИДом, Москва, Россия
Сантони А.
Симбирцев А.С. д.м.н., профессор, член-корреспондент РАН, научный руководитель ГосНИИ особо чистых биопрепаратов ФМБА России,
Санкт-Петербург, Россия
Тотолян Артем А. д.м.н., профессор, академик РАН, заслуженный деятель науки РФ, главный научный сотрудник отдела молекулярной
микробиологии Института экспериментальной медицины, Санкт-Петербург, Россия
Фрейдлин И.С. д.м.н., профессор, член-корреспондент РАН, заслуженный деятель науки РФ, главный научный сотрудник Института
экспериментальной медицины, Санкт-Петербург, Россия
Хаитов P.M.
д.м.н., профессор, академик РАН, заслуженный деятель науки РФ, научный руководитель ГНЦ Институт иммунологии
ФМБА России, Москва, Россия
Черешнев В.А. д.м.н., профессор, академик РАН, научный руководитель Института иммунологии и физиологии, Екатеринбург, Россия
Шпигель А.
д.м.н., профессор, директор Института Пастера Мадагаскара, Антананариву, Мадагаскар
зам. директора по научной работе Института Пастера в Риме, профессор иммунологии и иммунопатологии отдела молекулярной
медицины Университета Сапиенца в Риме, Рим, Италия
Стр.3
Редакционный совет
Алешкин В.А.
Бухарин О.В.
д.б.н., профессор, заслуженный деятель науки РФ, научный руководитель Московского НИИ эпидемиологии и микробиологии
им. Г.Н. Габричевского, Москва, Россия
д.м.н., профессор, академик РАН, Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза, Оренбург, Россия
Вишневский Б.И. д.м.н., профессор, главный научный сотрудник отдела лабораторной диагностики Санкт-Петербургского
НИИ фтизиопульмонологии, Санкт-Петербург, Россия
Долгушин И.И. д.м.н., профессор, академик РАН, заслуженный деятель науки РФ, президент Южно-Уральского государственного медицинского
университета, Челябинск, Россия
Зверев В.В.
д.б.н., профессор, академик РАН, научный руководитель НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова, зав. кафедрой
микробиологии, вирусологии и иммунологии Первого Московского государственного медицинского университета
им. И.М. Сеченова, Москва, Россия
Кафтырева Л.А. д.м.н., профессор, зав. лабораторией кишечных инфекций Санкт-Петербургского НИИ эпидемиологии и микробиологии
имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия
Кашкин К.П.
Кубарь О.И.
Малеев В.В.
д.м.н., профессор, академик РАН, профессор кафедры иммунологии Российской медицинской академии последипломного
образования МЗ РФ, Москва, Россия
д.м.н., профессор, ведущий научный сотрудник Санкт-Петербургского НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера,
Санкт-Петербург, Россия
д.м.н., профессор, академик РАН, советник директора Центрального НИИ эпидемиологии, зав. отделом инфекционной патологии,
Москва, Россия
Нарвская О.В. д.м.н., профессор, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики
Санкт-Петербургского НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия
Савичева А.М. д.м.н., профессор, зав. лабораторией микробиологии НИИ акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта,
Санкт-Петербург, Россия
Сельков С.А.
Тец В.В.
Харит С.М.
Чекнев С.Б.
Шкарин В.В.
д.м.н., профессор, зав. лабораторией иммунологии НИИ акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта,
Санкт-Петербург, Россия
д.м.н., профессор, зав. кафедрой микробиологии и вирусологии Первого Санкт-Петербургского государственного медицинского
университета им. И.П. Павлова, Санкт-Петербург, Россия
д.м.н., профессор, руководитель отдела профилактики инфекционных заболеваний ФГБУ Детский научно-клинический центр
инфекционных болезней ФМБА, Санкт-Петербург, Россия
д.м.н., зам. директора по научной работе ФНИЦ эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи МЗ РФ,
зав. лабораторией межклеточных взаимодействий, Москва, Россия
д.м.н., профессор, член-корреспондент РАН, заслуженный деятель науки РФ, президент Нижегородской государственной
медицинской академии, зав. кафедрой эпидемиологии, Нижний Новгород, Россия
Ответственный секретарь: Ракитянская Н.В. (Санкт-Петербург)
Редактор перевода: Исаков Д.В., к.м.н. (Санкт-Петербург)
Выпускающий редактор: Мурадян А.Я., к.м.н. (Санкт-Петербург)
Редактор электронной версии: Ерофеева В.С. (Санкт-Петербург)
Учредители
Северо-Западное отделение медицинских наук
Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Санкт-Петербургское региональное отделение Российской ассоциации аллергологов и клинических иммунологов
Журнал зарегистрирован Управлением Федеральной службы по надзору в сфере связи,
информационных технологий и массовых коммуникаций по Санкт-Петербургу и Ленинградской области
Свидетельство о регистрации ПИ № ТУ 78–00578 от 26 апреля 2010 г.
Свидетельство о регистрации ПИ № ТУ 78–00910 от 24 июня 2011 г.
Журнал зарегистрирован Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций
Свидетельство о регистрации ПИ № ФС 77–64788 от 02 февраля 2016 г.
Электронная версия журнала: www.iimmun.ru и www.elibrary.ru
C 2012 года журнал «Инфекция и иммунитет» входит в Перечень российских рецензируемых научных журналов, рекомендованных ВАК РФ,
в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученых степеней доктора и кандидата наук
C 2014 года журнал «Инфекция и иммунитет» включен в международную базу Ulrich’s Periodicals Directory
С 2016 года включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI), интегрированную с платформой Web of Science
С 2016 года журнал «Инфекция и иммунитет» включен в Web of Science (Emerging Sources Citation Index)
С 2017 года журнал «Инфекция и иммунитет» включен в международную базу Scopus
Адрес редакции:
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14.
Тел.: (812) 233-08-58.
Издательство НИИЭМ имени Пастера
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14.
Тел./факс: (812) 644-63-11.
E-mail: izdatelstvo@pasteurorg.ru
Подписано в печать 28.10.2022 г. Формат 60 x 90 1/8.
Печать офсетная. Усл.-печ. л. 25.
Тираж 2000 экз. (1-й завод – 1000 экз.).
Заказ № 1329
Типография ООО «Аллегро»
196084, Санкт-Петербург,
ул. Коли Томчака, 28.
Тел./факс: (812) 388-90-00.
© Инфекция и иммунитет
© Северо-Западное отделение медицинских наук, 2022
© НИИЭМ имени Пастера, 2022
© СПб РО РААКИ, 2022
Стр.4
NORTH-WEST REGIONAL BRANCH OF MEDICAL SCIENCES
SAINT PETERSBURG PASTEUR INSTITUTE
RUSSIAN ASSOCIATION OF ALLERGOLOGISTS AND CLINICAL IMMUNOLOGISTS,
ST. PETERSBURG REGIONAL BRANCH (SPb RAACI)
Russian Journal
of Infection and Immunity
(Infektsiya i immunitet)
September–October
2022, volume 12
The journal is published with the assistance of the Branch of All-Russian Scientific and Practical Society
of Epidemiologists, Microbiologists and Parasitologists for St. Petersburg and Leningrad Region
Editor-in-сhief
Areg A. Totolian
No. 5
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, St. Petersburg Pasteur Institute of Epidemiology and Microbiology, Director,
Head of the Laboratory of Molecular Immunology, St. Petersburg, Russian Federation
Deputy editor-in-chief
Igor V. Mokrousov
PhD, MD (Biology), St. Petersburg Pasteur Institute, Head of the Laboratory of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics,
St. Petersburg, Russian Federation
Members of editorial board
Alexander S. Apt
Luis Barbeito
Paul Brey
Irina N. Lavrentieva
Yuri V. Lobzin
Hechmi Louzir
Dmitry K. Lvov
Ken Maeda
Nikolai V. Medunitsyn
Michael I. Michailov
Hristo Najdenski
Vadim V. Pokrovskiy
Angela Santoni
Andrei S. Simbirtsev
Artem A. Totolian
Irina S. Freidlin
Rahim M. Khaitov
Valery A. Chereshnev
Andre Spiegel
PhD, MD (Biology), Professor, Central Research Institute of Tuberculosis, Head of the Laboratory of Immunogenetics, Moscow,
Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, Institute Pasteur de Montevideo, Head of the Laboratory of Neurodeneration, Montevideo,
Uruguay
PhD, MD (Biology), Professor, Institute Pasteur du Laos, Director; Laboratory of Medical Entomology and Biology of Disease
Vectors, Head, Vientiane, Laos
Alexander L. Gintsburg PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, N.F. Gamaleya Federal Center of Epidemiology and Microbiology, Director,
Moscow, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), St. Petersburg Pasteur Institute, Head of the Laboratory of Experimental Virology, St. Petersburg,
Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, Pediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases,
Scientiic Director, St. Petersburg, Russian Federation
Professor, Institute Pasteur de Tunis, President, Tunis, Tunisia
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, D.I. Ivanovsky Institute of Virology, N.F. Gamaleya Federal Center
of Epidemiology and Microbiology, Moscow, Russian Federation
PhD, MD (Veterinary), Professor, National Institute of Infectious Diseases, Director, Tokio, Japan
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, Scientific Center for Expertise of Medical Products, Moscow, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Corresponding Member, I.I. Mechnikov Institute of Vaccines and Sera, Head of the Laboratory
of Viral Hepatitis; Peoples’ Friendship University of Russia, Head of the Department of Microbiology and Virology, Moscow,
Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, Institute Stephan Angeloff; Head of the Department of Infectious Microbiology, Sofia, Bulgaria
Gennadiy G. Onishchenko PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, Deputy President of the Russian Academy of Education, Moscow,
Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, Central Research Institute of Epidemiology, Head of the Federal AIDS Center,
Moscow, Russian Federation
PhD, Professor, Institute Pasteur-Fondation Cenci Bolognetti, Scientific Director; Full Professor of Immunology
and Immunopathology, Department of Molecular Medicine, Sapienza University of Rome, Rome, Italy
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Corresponding Member, St. Petersburg Institute of Pure Biochemicals, Scientific Director,
St. Petersburg, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, Institute of Experimental Medicine, Department of Molecular Microbiology,
Head Researcher, St. Petersburg, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Corresponding Member, Institute of Experimental Medicine, Head Researcher,
St. Petersburg, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, Institute of Immunology, Scientific Director, Moscow, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, Institute of Immunology and Physiology, Scientific Director, Yekaterinburg,
Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, Institute Pasteur de Madagascar, Director, Antananarivo, Madagascar
Стр.5
Members of editorial council
Vladimir A. Aleshkin PhD, MD (Biology), Professor, G.N. Gabrichevsky Research Institute of Epidemiology and Microbiology, Scientific Director, Moscow,
Russian Federation
Oleg V. Bukharin
Boris I. Vishnevsky
Ilja I. Dolgushin
Vitaly V. Zverev
Lidiia A. Kaftyreva
Kirill P. Kashkin
Olga I. Kubar
Victor V. Maleev
Olga V. Narvskaya
Sergei A. Selkov
Viktor V. Tets
Susanna M. Kharit
Sergei B. Cheknev
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, Research Institute of Cellular and Intracellular Symbiosis, Scientific Director,
Orenburg, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, Research Institute of Phthisiopulmonology, Head Researcher, Department of Laboratory Diagnostic,
St. Petersburg, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, Chelyabinsk State Medical Academy, President, Moscow, Russian Federation
PhD, MD (Biology), Professor, RAS Full Member, I.I. Mechnikov Institute of Vaccines and Sera, Scientific Director, Moscow,
Russian Federation; I.M. Sechenov State Medical University, Head of the Department of Microbiology, Virology and Immunology,
Moscow, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, St. Petersburg Pasteur Institute, Head of the Laboratory of Intestinal Infections, St. Petersburg,
Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, Russian Academy of Postgraduate Medical Education, Professor of the Department
of Immunology, Moscow, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, St. Petersburg Pasteur Institute, Leading Researcher, St. Petersburg, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, Central Research Institute of Epidemiology, Adviser of the Director, Moscow,
Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, St. Petersburg Pasteur Institute, Laboratory of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics,
St. Petersburg, Leading Researcher, Russian Federation
Alevtina M. Savicheva PhD, MD (Medicine), Professor, D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology, Head of the Laboratory
of Microbiology, St. Petersburg, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology, Head of the Laboratory
of Immunology, St. Petersburg, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, Pavlov State Medical University, Head of the Department of Microbiology and Virology, St. Petersburg,
Russian Federation
PhD, MD (Medicine), Professor, Pediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases, Head of the Prevention Department
of Infectious Diseases, St. Petersburg, Russian Federation
PhD, MD (Medicine), N.F. Gamaleya Federal Center of Epidemiology and Microbiology, Deputy Director on Science,
Head of the Laboratory of Cellular Interactions, Moscow, Russian Federation
Vyacheslav V. Shkarin PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Corresponding Member, State Medical Academy, President, Head of the Department
of Epidemiology, Nizhny Novgorod, Russian Federation
Assistant еditor: Natalia V. Rakitianskaia (St. Petersburg)
Translation editor: Dmitrii V. Isakov (St. Petersburg)
Copy editor: Aram Yа. Muradyan (St. Petersburg)
Online version editorial manager: Vera S. Erofeeva (St. Petersburg)
Founders
North-West Regional Branch of Medical Sciences
Saint Petersburg Pasteur Institute
Russian Association of Allergologists and Clinical Immunologists, St. Petersburg Regional Branch (SPb RAACI)
The journal is registered by the Federal Service for Supervision of Communications, Information Technology
and Mass media in Saint Petersburg and Leningrad region
Certificate of registration PI no. TU 78–00578 from April, 26, 2010
Certificate of registration PI no. TU 78–00910 from June, 24, 2011
The journal is registered by the Federal Service for Supervision of Communications, Information Technology and Mass Media
Certificate of registration PI no. FS 77–64788 from February, 02, 2016
Electronic version: www.iimmun.ru and www.elibrary.ru
Since 2012, the Infection and Immunity journal is admitted to the Index of leading peer-rewieded scientific journals intended for publication of key
research results of MD Theses, as reccomended by the Higher Attestation Comission of the Russian Ministry of Education and Science
Since 2014 the Infection and Immunity journal is included into international Ulrich’s Periodicals Directory database
Since 2016 included in Russian Science Citation Index (RSCI) database, integrated in Web of Science
Since 2016 the Russian Journal of Infection and Immunity is included in Web of Science (Emerging Sources Citation Index)
Since 2017 the Russian Journal of Infection and Immunity is included into international Scopus database
Editorial Office
197101, St. Petersburg, Mira str., 14.
Тел.: (812) 233-08-58.
Publishing House of St. Petersburg Pasteur Institute
197101, St. Petersburg, Mira str., 14.
Phone/fax: (812) 644-63-11.
E-mail: izdatelstvo@pasteurorg.ru
Passed for printing 28.10.2022. Print format 60 x 90 1/8.
Offset printing. Printed sheets 25.
Circulation 2000 copies. (1st
edition – 1000 copies).
Produced at the Allegro Printing House
196084, Russian Federation, St. Petersburg,
Koli Tomchaka str., 28.
Phone/fax: (812) 388-90-00.
© Russian Journal of Infection and Immunity =
Infektsiya i immunitet
© North-West Regional Branch of Medical Sciences, 2022
© St. Petersburg Pasteur Institute, 2022
© SPb RAACI, 2022
Стр.6
Инфекция и иммунитет
2022, Т. 12, № 5
СОДЕРЖАНИЕ
Обзоры
Сунцов В.В.
ЭКОЛОГИЧЕСКИЙ СЦЕНАРИЙ ВИДООБРАЗОВАНИЯ МИКРОБА ЧУМЫ YERSINIA PESTIS
КАК ОСНОВА АДЕКВАТНОЙ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ЭВОЛЮЦИОННОЙ МОДЕЛИ .................................................. 809
Лоскутов С.И., Прошин С.Н., Рябухин Д.С.
ЭВОЛЮЦИОННЫЕ АСПЕКТЫ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ МИКРОБИОМА ЖЕЛУДОЧНО-КИШЕЧНОГО ТРАКТА
И ОРГАНИЗМА-ХОЗЯИНА В ФОРМИРОВАНИИ ЦЕЛОСТНОСТИ ГАСТРОИНТЕСТИНАЛЬНОГО БАРЬЕРА .............. 819
Коротецкая М.В., Рубакова Э.И.
МЕТАБОЛИЧЕСКИЕ БИОЛОГИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ ДИАГНОСТИКИ И МОНИТОРИНГА
ТЕЧЕНИЯ ТУБЕРКУЛЕЗА ..................................................................................................................... 827
Оригинальные статьи
Форгани М., Фирстков А.Л., Аляннеджади М.М., Даниленко Д.М., Комиссаров А.Б.
КОДИРОВАНИЕ С ПОМОЩЬЮ СОКРАЩЕННОГО АМИНОКИСЛОТНОГО АЛФАВИТА И ЕГО ВЛИЯНИЕ
НА МОДЕЛИРОВАНИЕ АНТИГЕННОЙ ЭВОЛЮЦИИ ГРИППА ........................................................................ 837
Нестерова И.В., Халтурина Е.О., Нелюбин В.Н., Хайдуков С.В., Чудилова Г.А.
ОЦЕНКА ВЛИЯНИЯ СИНТЕТИЧЕСКОГО ТИМИЧЕСКОГО ГЕКСАПЕПТИДА В СИСТЕМЕ IN VITRO
НА УРОВНИ ЭКСПРЕССИИ NF-κB, IFNα/βR И CD119 НЕЙТРОФИЛЬНЫХ ГРАНУЛОЦИТОВ
У ПАЦИЕНТОВ С ХРОНИЧЕСКИМИ ГЕРПЕСВИРУСНЫМИ КОИНФЕКЦИЯМИ .................................................. 850
Арсентьева Н.А., Любимова Н.Е., Бацунов О.К., Коробова З.Р., Кузнецова Р.Н., Рубинштейн А.А., Станевич О.В.,
Лебедева А.А., Воробьев Е.А., Воробьева С.В., Куликов А.Н., Гаврилова Е.Г., Певцов Д.Э., Полушин Ю.С.,
Шлык И.В., Тотолян А.А.
ПРОГНОЗНАЯ ЗНАЧИМОСТЬ СПЕЦИФИЧЕСКИХ ЦИТОКИНОВ В ОТНОШЕНИИ
ЛЕТАЛЬНОГО ИСХОДА COVID-19 .......................................................................................................... 859
Рази А., Азимян А., Арезуманд Р., Солати А., Ахмадабад Х.Н.
СВЯЗЬ УРОВНЯ СЫВОРОТОЧНЫХ С3, С4 И ОБЩЕЙ АКТИВНОСТИ КЛАССИЧЕСКОГО ПУТИ АКТИВАЦИИ
КОМПЛЕМЕНТА У ПАЦИЕНТОВ С COVID-19 ПРИ ГОСПИТАЛИЗАЦИИ С КЛИНИЧЕСКИМ ИСХОДОМ .................... 869
Самсонова А.П., Петров Е.М., Савельева О.В., Иванова А.Е., Шарапова Н.Е.
АНАЛИЗ ДОКУМЕНТИРОВАННЫХ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЯ СЫВОРОТОК КРОВИ БОЛЬНЫХ,
ПОДОЗРИТЕЛЬНЫХ НА ЗАБОЛЕВАНИЕ ЛЕПТОСПИРОЗАМИ, В РЕАКЦИИ МИКРОАГГЛЮТИНАЦИИ .................. 875
Токаревич Н.К., Блинова О.В., Стоянова Н.А., Баимова Р.Р., Сюзюмова Е.А., Ломоносова В.И., Тронин А.А.,
Бузинов Р.В., Соколова О.В., Гнатив Б.Р., Буц Л.В., Бубнова Л.А., Сафонова О.С., Станкевич А.И., Калинина Е.Л.,
Виксе Р., Андреассен А.К.
СЕРОПРЕВАЛЕНТНОСТЬ КЛЕЩЕВЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ В СЕВЕРО-ЗАПАДНОМ ФЕДЕРАЛЬНОМ ОКРУГЕ
РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ ................................................................................................................ 891
Лаврентьева И.Н., Бичурина М.А., Антипова А.Ю., Камара Ж., Хоанг М., Банчевич М.Д., Железнова Н.В.,
Егорова С.А., Тотолян А.А.
КОЛЛЕКТИВНЫЙ ИММУНИТЕТ К ВИРУСУ КРАСНУХИ В НЕКОТОРЫХ ГЕОГРАФИЧЕСКИХ РЕГИОНАХ ................. 902
Цвиркун О.В., Самойлович Е.О., Тихонова Н.Т., Герасимова А.Г., Тураева Н.В., Ермолович М.А., Семейко Г.В.
CОПОСТАВЛЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЯ СОСТОЯНИЯ ПОПУЛЯЦИОННОГО ИММУНИТЕТА
К ВИРУСУ КРАСНУХИ У НАСЕЛЕНИЯ РЕСПУБЛИКИ БЕЛАРУСЬ И РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ .......................... 909
Терешко Д.Л., Новицкая И.В., Захарова И.Б., Чиен Д., Кузнецов А.Н., Кулаков М.Я., Будченко А.А., Пушкарь В.Г.,
Викторов Д.В., Топорков А.В.
ПОЛУЧЕНИЕ И ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ЭРИТРОЦИТАРНОГО АНТИГЕННОГО МЕЛИОИДОЗНОГО
ДИАГНОСТИКУМА ПРИ АНАЛИЗЕ ПРОБ СЫВОРОТОК ОТ ЛИЦ ИЗ ЭНДЕМИЧНЫХ ПО МЕЛИОИДОЗУ
ПРОВИНЦИЙ ХА ЗАНГ, ЛАНГШОН И КУАНГНИНЬ СОЦИАЛИСТИЧЕСКОЙ РЕСПУБЛИКИ ВЬЕТНАМ ..................... 919
805
Стр.7
Содержание
Инфекция и иммунитет
Воропаев А.Д., Екатеринчев Д.А., Урбан Ю.Н., Зверев В.В., Несвижский Ю.В., Воропаева Е.А., Лиханская Е.И.,
Афанасьев М.С., Афанасьев С.С.
ЭКСПРЕССИЯ CDR1, CDR2, MDR1 И ERG11 У УСТОЙЧИВЫХ К АЗОЛАМ ШТАММОВ СANDIDA ALBICANS,
ВЫДЕЛЕННЫХ ОТ ВИЧ-ИНФИЦИРОВАННЫХ ПАЦИЕНТОВ В ГОРОДЕ МОСКВЕ ............................................. 929
Самойленко Е.С., Колесникова Н.В., Баклай В.И., Майданникова Е.Ю., Омельченко Е.В.
ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ VEGF ПРИ ОСЛОЖНЕННОМ ИНФЕКЦИОННОМ ЭНДОКАРДИТЕ ................................. 938
Вализаде Г., Хамсе М.-Э., Кашаниян М., Рафии-Сефиддашти Р., Хадиги Р.
РОЛЬ TOXOPLASMA GONDII ПРИ ТИРЕОИДИТЕ БЕРЕМЕННЫХ ЖЕНЩИН ..................................................... 947
Скупневский С.В., Пухаева Е.Г., Бадтиев А.К., Руруа Ф.К., Батагова Ф.Э., Фарниева Ж.Г.
ПОВЫШЕНИЕ БЕЗОПАСНОСТИ ВАКЦИНОПРОФИЛАКТИКИ НА ОСНОВЕ МАСЛЯНЫХ АДЪЮВАНТОВ ................ 953
Краткие сообщения
Котенева Е.А., Цыганкова О.И., Щербакова В.Ю., Калинин А.В., Родионов И.С., Сердюков В.В.,
Абрамович А.В., Куличенко А.Н.
ЦИТОКИНОВЫЙ ПРОФИЛЬ КУЛЬТУРЫ МЫШИНЫХ МАКРОФАГОВ IN VITRO ПРИ ИНФИЦИРОВАНИИ
СПОРАМИ BACILLUS ANTHRACIS С РАЗНЫМ ПЛАЗМИДНЫМ СОСТАВОМ ..................................................... 963
Курашова С.С., Баловнева М.В., Ишмухаметов А.А., Теодорович Р.Д., Попова Ю.В., Ткаченко Е.А., Дзагурова Т.К.
ГУМОРАЛЬНЫЙ ИММУННЫЙ ОТВЕТ ПОСЛЕ ИММУНИЗАЦИИ МОРСКИХ СВИНОК ВАКЦИННЫМ
ПРЕПАРАТОМ НА ОСНОВЕ ВИРУСА ПУУМАЛА ......................................................................................... 971
Методы
Огарков О.Б., Жданова С.Н., Орлова Е.А., Хромова П.А., Белькова Н.Л., Синьков В.В., Кондратов И.Г.
СЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-ITS-23S ФРАГМЕНТА РИБОСОМАЛЬНОГО ОПЕРОНА ОБЕСПЕЧИВАЕТ
НЕОБХОДИМЫЕ И ДОСТАТОЧНЫЕ УСЛОВИЯ ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ МИКОБАКТЕРИЙ ................................. 976
Сайтгалина М.А., Останкова Ю.В., Любимова Н.Е., Семенов А.В., Кузнецова Р.Н., Тотолян А.А.
МОДИФИЦИРОВАННЫЙ МЕТОД КОЛИЧЕСТВЕННОГО ОПРЕДЕЛЕНИЯ УРОВНЕЙ TREC И KREC
В ПЕРИФЕРИЧЕСКОЙ КРОВИ У БОЛЬНЫХ С ИММУНОДЕФИЦИТНЫМИ СОСТОЯНИЯМИ ................................. 981
Правила для авторов .............................................................................................................. 997
Авторский указатель ............................................................................................................. 1000
Предметный указатель ......................................................................................................... 1000
806
Стр.8
Russian Journal of Infection and Immunity (Infektsiya i immunitet)
2022, vol. 12, no. 5
CONTENTS
Reviews
Suntsov V.V.
ECOLOGICAL SCENARIO OF THE PLAGUE MICROBE YERSINIA PESTIS SPECIATION UNDERLYING
ADEQUATE MOLECULAR EVOLUTIONARY MODEL ...................................................................................... 809
Loskutov S.I., Proshin S.N., Ryabukhin D.S.
EVOLUTIONARY ASPECTS OF GASTROINTESTINAL TRACT MICROBIOME-HOST INTERACTION
UNDERLYING GASTROINTESTINAL BARRIER INTEGRITY ............................................................................. 819
Korotetskaya M.V., Rubakova E.I.
METABOLIC BIOLOGICAL MARKERS FOR DIAGNOSING AND MONITORING THE COURSE
OF TUBERCULOSIS ............................................................................................................................. 827
Original articles
Forghani M., Firstkov A.L., Alyannezhadi M.M., Danilenko D.M., Komissarov A.B.
REDUCED AMINO ACID ALPHABET-BASED ENCODING AND ITS IMPACT ON MODELING INFLUENZA
ANTIGENIC EVOLUTION ....................................................................................................................... 837
Nesterova I.V., Khalturina E.O., Nelyubin V.N., Khaidukov S.V., Chudilova G.A.
EVALUATION OF THE EFFECTS IN THE IN VITRO SYSTEM OF SYNTHETIC THYMIC HEXAPEPTIDE
ON THE EXPRESSION LEVELS OF NF-κB, IFNα/βR AND CD119 NEUTROPHILIC GRANULOCYTES
IN PATIENTS WITH CHRONIC HERPES VIRAL CO-INFECTIONS ...................................................................... 850
Arsentieva N.A., Liubimova N.E., Batsunov O.K., Korobova Z.R., Kuznetsova R.N., Rubinstein A.A., Stanevich O.V.,
Lebedeva A.A., Vorobyov E.A., Vorobyova S.V., Kulikov A.N., Gavrilova E.G., Pevtcov D.E., Polushin Yu.S.,
Shlyk I.V., Totolian A.A.
PREDICTIVE VALUE OF SPECIFIC CYTOKINES FOR LETHAL COVID-19 OUTCOME .............................................. 859
Razi A., Azimian A., Arezumand R., Solati A., Ahmadabad H.N.
ASSOCIATIONS BETWEEN SERUM LEVELS OF C3, C4, AND TOTAL CLASSICAL COMPLEMENT ACTIVITY
IN COVID-19 PATIENTS AT THE TIME OF ADMISSION AND CLINICAL OUTCOME ................................................. 869
Samsonova A.P., Petrov E.M., Savelyeva O.V., Ivanova A.E., Sharapova N.E.
ANALYZYING THE DOCUMENTED RESULTS BY USING MICROSCOPIC AGGLUTINATION TEST
TO EXAMINE SERA FROM PATIENTS SUSPECTED OF LEPTOSPIROSIS ........................................................... 875
Tokarevich N.K., Blinova O.V., Stoyanova N.A., Baimova R.R., Siuziumova E.A., Lomonosova V.I., Tronin A.A.,
Buzinov R.V., Sokolova O.V., Gnativ B.R., Buts L.V., Bubnova L.A., Safonova O.S., Stankevich A.I., Kalinina E.L.,
Vikse R., Andreassen A.K.
SEROPREVALENCE OF TICK-BORNE DISEASES IN THE NORTHWEST FEDERAL DISTRICT
OF THE RUSSIAN FEDERATION .............................................................................................................. 891
Lavrentieva I.N., Bichurina M.A., Antipova A.Yu., Camara J., Hoang M., Bancevic M.D., Zheleznova N.V.,
Egorova S.A., Totolian A.A.
A HERD IMMUNITY TO RUBELLA VIRUS IN SELECTED GEOGRAPHICAL REGIONS .............................................. 902
Tsvirkun O.V., Samoilovich E.O., Tikhonova N.T., Gerasimova A.G., Turaeva N.V., Ermolovich M.A., Semeiko G.V.
STATE OF ANTI-RUBELLA VIRUS POPULATION IMMUNITY IN THE REPUBLIC OF BELARUS
AND RUSSIAN FEDERATION .................................................................................................................. 909
Tereshko D.L., Novitskaya I.V., Zakharova I.B., Trien D., Kuznetsov A.N., Kulakov M.Ya., Budchenko A.A., Pushkar V.G.,
Viktorov D.V., Toporkov A.V.
OBTAINING AND USING ERYTHROCYTE ANTIGENIC MELIIDOSIS DIAGNOSTIC AGENT IN THE ANALYSIS
OF SERUM SAMPLES FROM MELIIDOSIS-ENDEMIC PROVINCES HA GIANG, LANG SON AND QUANG NINH
OF THE SOCIALIST REPUBLIC OF VIETNAM .............................................................................................. 919
807
Стр.9
Contents
Russian Journal of Infection and Immunity
Voropaev A.D., Yekaterinchev D.A., Urban Yu.N., Zverev V.V., Nesvizhsky Yu.V., Voropaeva E.A., Likhanskaya E.I.,
Afanasiev M.S., Afanasiev S.S.
CDR1, CDR2, MDR1 AND ERG11 EXPRESSION IN AZOLE RESISTANT СANDIDA ALBICANS ISOLATED
FROM HIV-INFECTED PATIENTS IN CITY OF MOSCOW ................................................................................. 929
Samoylenko E.S., Kolesnikova N.V., Baklay V.I., Maydannikova E.Yu., Omelchenko E.V.
VEGF GENE POLYMORPHISM IN COMPLICATED INFECTIVE ENDOCARDITIS .................................................... 938
Valizadeh G., Khamseh M.-E., Kashaniyan M., Rafiei-Sefiddashti R., Hadighi R.
ROLE OF TOXOPLASMA GONDII IN THYROIDITIS IN PREGNANT WOMEN ......................................................... 947
Skupnevskii S.V., Pukhaeva E.G., Badtiev A.K., Rurua F.K., Batagova F.E., Farnieva Zh.G.
IMPROVING SAFETY OF OIL ADJUVANT-BASED VACCINES ........................................................................... 953
Short communications
Koteneva E.A., Tsygankova O.I., Shcherbakova V.Yu., Kalinin A.V., Rodionov I.S., Serdyukov V.V.,
Abramovich A.V., Kulichenko A.N.
CYTOKINE PROFILE IN IN VITRO MOUSE MACROPHAGE CULTURE INFECTED WITH BACILLUS ANTHRACIS
SPORES WITH VARYING PLASMID COMPOSITION ...................................................................................... 963
Kurashova S.S., Balovneva M.V., Ishmukhametov A.A., Teodorovich R.D., Popova Yu.V., Tkachenko E.A., Dzagurova T.K.
IMMUNE RESPONSE EVALUATION IN THE GUINEA PIGS AFTER IMMUNIZATION WITH THE EXPERIMENTAL
PUUMALA VIRUS VACCINE .................................................................................................................... 971
Methods
Ogarkov O.B., Zhdanova S.N., Orlova E.A., Khromova P.A., Belkova N.L., Sinkov V.V., Kondratov I.G.
16S-ITS-23S rRNA OPERON SEGMENT SEQUENCING PROVIDES NECESSARY AND SUFFICIENT
CONDITIONS FOR BACTERIAL SPECIES-SPECIFIC IDENTIFICATION ............................................................... 976
Saitgalina M.A., Ostankova Yu.V., Liubimova N.E., Semenov A.V., Kuznetsova R.N., Totolian A.A.
MODIFIED QUANTITATIVE APPROACH FOR ASSESSING PERIPHERAL BLOOD TREC AND KREC LEVELS
IN IMMUNODEFICIENT PATIENTS ........................................................................................................... 981
Instructions to Authors ........................................................................................................... 997
Author index ................................................................................................................................ 1000
Subject index ........................................................................................................................... 1000
808
Стр.10