68–74 УДК 577.271.34 IN VITRO-СЕЛЕКЦИЯ 2'-F-МОДИФИЦИРОВАННЫХ РНК-АПТАМЕРОВ, ПРОНИКАЮЩИХ ВНУТРЬ БАКТЕРИАЛЬНЫХ КЛЕТОК PSEUDOMONAS AERUGINOSA1 © 2017 г. А. С. Давыдова# , М. А. Воробьева, М. Р. Кабилов, Н. В. Тикунова, Д. В. Пышный, А. Г. Веньяминова Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН, 630090, Новосибирск, просп. акад. <...> Перспективный путь ее решения состоит в использовании ДНК- и РНК-аптамеров, направленных на определенные бактерии. <...> В работе предложен новый протокол отбора 2'-фтор-РНК-аптамеров, способных проникать внутрь бактериальных клеток. <...> Методом SELEX с использованием в качестве мишени для отбора культуры бактерий Pseudomonas aeruginosa получена обогащенная библиотека 2'-фтор-РНК, проведено ее секвенирование и анализ данных. <...> Показано, что центральный фрагмент преобладающей в библиотеке аптамерной последовательности совпадает с фрагментом 16S рРНК. <...> Продемонстрирована способность полученного аптамера проникать в клетки P. aeruginosa. <...> Высказано предположение о проникновении аптамеров в бактерии в виде гетеродимерных комплексов. <...> Ключевые слова: РНК-аптамеры, 2'-фтор-РНК, селекция in vitro, проникающие аптамеры, аптамеры к бактериям. <...> Появление антибиотиков коренным образом изменило возможности лечения бактериальных инфекций, однако такие проблемы, как побочные эффекты антибиотикотерапии, а также растущая лекарственная устойчивость микроорганизмов, остаются чрезвычайно острыми (см., например, [1]). <...> Список сокращений: BSA – бычий сывороточный альбумин, SELEX (Systematic Evolution of Ligands by exponential enrichment) – систематическаяэволюция лигандов путем экспоненциального обогащения, КОЕ – колониеобразующая единица, ОТ-ПЦР – полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией; рРНК и тРНК – рибосомальная и транспортная РНК. <...> Аптамеры представляют собой синтетические молекулы ДНК или РНК, которые за счет образования уникальной пространственной структуры способны высокоспецифично узнавать определенные молекулы-мишени <...>