1 МетОд сеКвенИРОвАнИЯ РнК (RNA-SEQ) в ИММУнОлОГИЧесКИХ ИсследОвАнИЯХ 1 Лаборатория иммунохими ФГБУ «ГНЦ Институт иммунологии» ФМБА России, 115478, г. Москва, Россия; 2 Биологический факультет ФГБОУ ВПО «Московский государственный университет им. <...> М.В. Ломоносова», 119234, г. Москва, Россия Транскриптом является связующим звеном между ДНК и белками. <...> Недавно появившийся высокопроизводительный метод RNA-seq вывел транскриптомные исследования на новый уровень. <...> Он позволяет идентифицировать новые элементы генома и определять особенности экспрессии генов. <...> Транскриптом включает не только кодирующие, но и регуляторные молекулы РНК, количественный диапазон которых огромен. <...> Первые методы изучения экспрессии генов (Nothern Blot, qPCR) позволяли детектировать небольшое количество транскриптов. <...> Следом появились высокопроизводительные методы на основе гибридизации (микрочипы), благодаря которым стало возможным исследовать экспрессию генов на уровне целых геномов. <...> В 2008 г. был предложен метод секвенирования РНК (RNAseq), основанный на секвенировании нового поколения с использованием фрагментов кДНК. <...> Благодаря методу глубокого секвенирования RNA-seq способен различать индивидуальные однонуклеотидные полиморфизмы (SNPs). <...> Кроме того, с его помощью можно количественно сравнивать экспрессию генов в разных образцах [2]. <...> Первое направление касается аннотации новых элементов генома. <...> Так, с помощью RNA-seq можно идентифицировать новые гены, включая последовательности некодирующих РНК, сайты начала транcкрипции, сплайс-варианты, аллельспецифичную экспрессию, SNPs, слияния генов, границы экзонов и интронов, а также явления редактирования РНК [1]. <...> Второе направление использования RNA-seq — анализ дифференциальной экспрессии генов. <...> В этом случае ставится задача сравнить транскриптомы из двух или более образцов и определить транскрипты с различающейся экспрессией. <...> Наконец, RNA-seq позволяет анализировать образцы с очень малым содержанием РНК <...>