Национальный цифровой ресурс Руконт - межотраслевая электронная библиотека (ЭБС) на базе технологии Контекстум (всего произведений: 645695)
Контекстум
Молекулярная биология  / №2 2017

ТРАНСЛЯЦИОННАЯ ЭФФЕКТИВНОСТЬ BVDV IRES И EMCV IRES ПРИ ЦИТОПЛАЗМАТИЧЕСКОЙ ЭКСПРЕССИИ С УЧАСТИЕМ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ Т7 В КЛЕТОЧНЫХ ЛИНИЯХ МЛЕКОПИТАЮЩИХ (200,00 руб.)

0   0
Первый авторMadadgar
АвторыRoohvand F., Rasekhian M., Etemadzadeh M.H., Langroudi A.G., Azadmanesh K.
Страниц10
ID593692
АннотацияСистемы цитоплазматической экспрессии на основе T7-полимеразы в клетках млекопитающих широко применяются в молекулярно-биологических исследованиях. В большинстве таких систем используется сайт внутренней посадки рибосомы (internal ribosome entry site; IRES) мРНК вируса энцефаломиокардита (encephalomyocarditis virus; EMCV). Для осуществления процесса кеп-независимой трансляции этому типу IRES могут потребоваться различные факторы из клетки хозяина, и это затрудняет работу с ними. Другие IRES могут быть менее зависимы от клеточных факторов хозяина, но их свойства изучены в меньшей степени. Нами проведено сравнение трансляционной эффективности двух IRES – из вируса диареи крупного рогатого скота (bovine viral diarrhea virus; BVDV) и из ECMV. Оба IRES проанализированы в репортерных векторах, состоящих из T7-промотора, выбранного IRES и кодирующей последовательности усиленного зеленого флуоресцентного белка (enhanced green fluorescent protein; EGFP). Для обеспечения экспрессии РНК-полимеразы T7 соответствующий ген выделяли из Escherichia coli и вводили его в плазмидный вектор pCDNA3.1-Hygro(+). После котрансфекции этого вектора с одним из репортерных векторов в клетки линий T7-BHK (из почки новорожденного хомячка), HEK 293T (из почки эмбриона человека), CHO (из яичника китайского хомячка) и в клетки HeLa исследовали трансляционную эффективность репортерной конструкции методами флуоресцентной микроскопии и проточной цитометрии. В клетках T7-BHK, HEK 293T и HeLa трансляционная эффективность BVDV IRES оказалась в 2–3 раза выше, чем EMCV IRES. В клетках CHO трансляционная эффективность BVDV IRES и EMCV IRES была одинакова. При анализе вторичной структуры мРНК показано, что для молекул, несущих EMCV IRES и BVDV IRES, значения величины ΔG соответствуют –544.00 и –469.40 ккал/моль. Поскольку мРНК, содержащая EMCV IRES, более стабильна, очевидно, что повышенная трансляционная эффективность конструкций с BDVD IRES обусловлена другими, пока не идентифицированными, факторами. В целом полученные нами результаты свидетельствуют об определенном потенциале BVDV IRES в плане замены EMCV IRES, который в настоящее время широко используется в системах на основе T7-полимеразы для цитоплазматической экспрессии исследуемых генов или в экспериментах со спасением вирусных кДНК.
УДК577.217.52
ТРАНСЛЯЦИОННАЯ ЭФФЕКТИВНОСТЬ BVDV IRES И EMCV IRES ПРИ ЦИТОПЛАЗМАТИЧЕСКОЙ ЭКСПРЕССИИ С УЧАСТИЕМ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ Т7 В КЛЕТОЧНЫХ ЛИНИЯХ МЛЕКОПИТАЮЩИХ / O. Madadgar [и др.] // Молекулярная биология .— 2017 .— №2 .— С. 134-143 .— URL: https://rucont.ru/efd/593692 (дата обращения: 18.07.2024)

Предпросмотр (выдержки из произведения)

324–333 МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ КЛЕТКИ УДК 577.217.52 ТРАНСЛЯЦИОННАЯ ЭФФЕКТИВНОСТЬ BVDV IRES И EMCV IRES ПРИ ЦИТОПЛАЗМАТИЧЕСКОЙ ЭКСПРЕССИИ С УЧАСТИЕМ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ Т7 В КЛЕТОЧНЫХ ЛИНИЯХ МЛЕКОПИТАЮЩИХ# © 2017 г. F. <...> Etemadzadehb * aDepartment of Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran bDepartment of Virology, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran cDepartment of Pharmacognosy and Pharmaceutical Biotechnology, School of Pharmacy, Kermanshah University of Medical Science, Kermanshah, Iran *e-mail: azadmanesh@pasteur.ac.ir Поступила в редакцию 14.11.2015 г. Принята к печати 03.01.2016 г. Системы цитоплазматической экспрессии на основе T7-полимеразы в клетках млекопитающих широко применяются в молекулярно-биологических исследованиях. <...> В большинстве таких систем используется сайт внутренней посадки рибосомы (internal ribosome entry site; IRES) мРНК вируса энцефаломиокардита (encephalomyocarditis virus; EMCV). <...> Для осуществления процесса кеп-независимой трансляции этому типу IRES могут потребоваться различные факторы из клетки хозяина, и это затрудняет работу с ними. <...> Другие IRES могут быть менее зависимы от клеточных факторов хозяина, но их свойства изучены в меньшей степени. <...> Нами проведено сравнение трансляционной эффективности двух IRES – из вируса диареи крупного рогатого скота (bovine viral diarrhea virus; BVDV) и из ECMV. <...> Оба IRES проанализированы в репортерных векторах, состоящих из T7-промотора, выбранного IRES и кодирующей последовательности усиленного зеленого флуоресцентного белка (enhanced green fluorescent protein; EGFP). <...> Для обеспечения экспрессии РНК-полимеразы T7 соответствующий ген выделяли из Escherichia coli и вводили его в плазмидный вектор pCDNA3.1-Hygro(+). <...> После котрансфекции этого вектора с одним из репортерных векторов в клетки линий T7-BHK (из почки новорожденного хомячка), HEK 293T (из почки эмбриона человека), CHO (из яичника китайского хомячка) и в клетки HeLa исследовали трансляционную эффективность репортерной конструкции методами флуоресцентной микроскопии и проточной цитометрии. <...> В клетках T7-BHK, HEK 293T и HeLa трансляционная эффективность BVDV IRES оказалась в 2–3 раза выше, чем EMCV IRES. <...> В клетках CHO трансляционная эффективность <...>