2016; 61(9) DOI 10.18821/0869-2084-2016-61-9 Генетические и эпигенетические аберрации могут вызывать активацию онкогенов и инактивацию генов-супрессоров опухолевого роста и стимулировать развитие злокачественных опухолей. <...> Цель данной работы – идентифицировать гены хромосомы 3, подверженные гиперметилированию и/или делециям при раке молочной железы (РМЖ), которые можно использовать для диагностики этого заболевания. <...> Изменения статуса метилирования CpG-островков и числа копий ДНК исследованы с использованием сравнительной гибридизации ДНК на оригинальных NotI-микрочипах и с применением программного обеспечения NIMAN в 47 парных (опухоль/норма) образцах РМЖ. <...> Микрочипы содержали 180 NotI-клонов, связанных со 188 генами хромосомы 3, причем в основном, с их промоторными областями. <...> Изменение уровня мРНК генов определяли методом количественной ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ) с применением оригинального программного обеспечения. <...> Анализ метилирования проводили с помощью бисульфитного секвенирования. <...> В общей сложности, выявлены 35 NotI-сайтов с высокой частотой (15–38% образцов РМЖ) гиперметилирования / делеций (М/Д). <...> Среди генов, ассоциированных с этими сайтами, есть как известные, так и потенциальные онкосупрессоры (ALDH1L1, VHL, CTDSPL и т. д.), а также гены, для которых роль в патогенезе РМЖ показана впервые (LRRN1, FOXP1, PRICKLE2 и т. д.) <...> . Результаты, полученные на NotIмикрочипах, проверены с использованием бисульфитного секвенирования выборочно, а именно, для генов VHL, NKIRAS1, ITGA9, LRRC3B и CTDSPL. <...> Для ряда генов с высокой частотой М/Д (ALDH1L1, EPHB1, ITGA9 и ROPN1) определено изменение уровня экспрессии методом ПЦР-РВ. <...> Частое (в 57–90% образцов РМЖ) и значительное (> 2 раза) понижение экспрессии показано для всех генов с высокой частотой М/Д. <...> Эти гены являются новыми кандидатами на роль онкосупрессоров при РМЖ. <...> Функциональное гиперметилирование, ассоциированное с потерей экспрессии, показано для генов ALDH1L1, EPHB1, ITGA9, ROPN1, что согласуется с предположением об их онкосупрессорных <...>