Widespread adaptive evolution in the human immunodeficiency virus type 1 genome. <...> New insights into the origin of the HIV type 1 subtype A epidemic in former Soviet Union’s countries derived from sequence analyses of preepidemically transmitted viruses. <...> Identification of a possible ancestor of the subtype A1 HIV Type 1 variant circulating in the former Soviet Union. <...> ХаРакТЕРИСТИка ИЗОЛЯТОВ ВИРУСа кЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФаЛИТа ИЗ ПРИРОДНЫХ ОЧаГОВ В ИРкУТСкОЙ ОБЛаСТИ И УТОЧНЕНИЕ ГЕНОТИПИЧЕСкОГО ПЕЙЗажа ФКУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора, 664047, г. Иркутск иркутская область является уникальной территорией, на которой зафиксирована циркуляция вируса клещевого энцефалита (вКЭ) всех известных в настоящее время субтипов. в последние годы в некоторых областях Российской Федерации описан феномен смены субтипов вКЭ с замещением дальневосточного субтипа сибирским. в настоящей работе представлены результаты индивидуального исследования 11 522 экземпляров иксодовых клещей и проб мозга 81 мелкого млекопитающего, собранных в природных очагах КЭ на территории иркутской области с 2006 по 2014 г. выделено и исследовано вирусологическими методами более 60 штаммов вКЭ, 68 изолятов типированы по фрагменту гена Е (1193 п. н.). большинство штаммов независимо от субтипа продемонстрировали высокую вирулентность для лабораторных мышей (ЛМ) как при внутримозговом, так и при периферическом пути введения вируса. все штаммы, выделенные от теплокровных (мелких млекопитающих и человека), обладали высокой степенью вирулентности для ЛМ, но на филогенетическом древе попадали в один кластер с изолятами от клещей, собранных в том же районе. <...> «Клещевые» штаммы разной степени вирулентности также не образовывали отдельных кластеров на древе. <...> Филогенетический анализ показал, что генотипический пейзаж вКЭ на обследованной территории в настоящее время претерпевает изменения, характеризующиеся абсолютным преобладанием сибирского субтипа (94,1%), представленного двумя группами с прототипными штаммами заусаев и васильченко. группа штаммов васильченко <...>