2015.3.278rus «СЕКВЕНИРОВАНИЕ СЛЕДУЮЩЕГО ПОКОЛЕНИЯ» ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ТРАНСКРИПТОМНЫХ ПРОФИЛЕЙ ТКАНЕЙ И ОРГАНОВ ГОРОХА ПОСЕВНОГО ( L.) (обзор) В.А. ЖУКОВ, О.А. КУЛАЕВА, А.И. ЖЕРНАКОВ, И.А. ТИХОНОВИЧ Термин «секвенирование следующего поколения» (от англ. <...> Next Generation Sequencing, NGS) объединяет современные технологии, позволяющие получать информацию о нуклеотидном составе десятков и сотен миллионов последовательностей в одном эксперименте. <...> Технологии NGS используются для решения широкого круга задач (секвенирование геномов, оценка экспрессии генов, разработка молекулярных маркеров, изучение метагенома микробных сообществ, эпигенетические исследования и пр.) <...> . Одно из важнейших применений метода NGS связано с анализом экспрессии генов с помощью секвенирования транскриптома (всех транскрибируемых РНК). <...> В обзоре рассмотрены подходы, применяемые для тотального анализа экспрессии генов при помощи «секвенирования следующего поколения» — RNAseq (РНК-секвенирование) и его модификация MACE (Massive Analysis of cDNA Ends — массовый анализ концов кДНК). <...> В указанной модификации, разработанной компанией «GenXPro GmbH» (Франкфурт-на-Майне, Германия), у каждой молекулы кДНК секвенированию подвергается только фрагмент размером 100-500 п.н., прилежащий к 3´-концу транскрипта (в другом варианте — к 5´-концу транскрипта); таким образом, разрешение метода возрастает в несколько раз. <...> За счет этого при использовании MACE можно детектировать транскрипты с низкой экспрессией, соответствующие ключевым регуляторным генам, составляющим основу биологических процессов. <...> Также в обзоре описан функциональный анализ результатов РНК-секвенирования, в том числе выявление биологических закономерностей на основании обнаружения дифференциально экспрессирующихся генов. <...> Важный этап этой работы — иерархическая кластеризация выявляемых транскриптов в соответствии с принципами генной онтологии. <...> Гены и генные продукты, взаимодействуя друг с другом, образуют структурированную <...>