МУЛЬТИЛОКУСНОЕ СИКВЕНС-ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE РАзНОЙ ЭПИДЕМИчЕСКОЙ зНАчИМОСТИ ФКУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора, 664047, г. Иркутск Проведено исследование аллельного полиморфизма генов «домашнего хозяйства» (dnaE, lap, recA, pgm, gyrВ, cat, chi, gmd) штаммов Vibrio cholerae разной эпидемической значимости (n = 41), изолированных на территории Сибири и Дальнего Востока в период Vii пандемии холеры. <...> Установлено, что все токсигенные штаммы периода эпидемических осложнений независимо от времени и источника выделения характеризуются идентичным аллельным профилем и относятся к одному сиквенс-типу. <...> Среди эпидемически неопасных изолятов выявлено 9 сиквенс-типов и кластеризация их на дендрограмме, ассоциированная с принадлежностью к серогруппе и, в ряде случаев, с территорией и временем выделения. <...> Гетерогенность структуры генов «домашнего хозяйства», нетоксигенных V. cholera, обусловлена преимущественно синонимичными нуклеотидными заменами (Dn/Ds<1), что свидетельствует о преобладании на анализируемых участках генома холерного вибриона отрицательного отбора. <...> Выявленные различия структуры генов «домашнего хозяйства» холерного вибриона разной эпидемической значимости могут свидетельствовать о разных направлениях эволюции этих групп штаммов. <...> Ключевые слова: Vibrio cholera; мультилокусное сиквенстипирование, MLST; гены «домашнего хозяйства»; аллельный полиморфизм. <...> Исследование структуры комплекса генов жизнеобеспечения (гены «домашнего хозяйства», housekeeping genes) – мультилокусное сиквенс-типирование (Multilocus sequence typing – Mlst) – широко применяется в молекулярно-эволюционном анализе для установления филогенетической истории и популяционной структуры микроорганизмов [1, 2]. <...> Известно, что гены домашнего хозяйства характеризуются достаточно низкой скоростью накопления и закрепления мутаций, что снижает эффективность использования мультилокусного сиквенс-типирования в изучении <...>