ПРЕДСКАЗАНИЕ ВАРИАБЕЛЬНЫХ УЧАСТКОВ В ДОМЕННОЙ СТРУКТУРЕ БЕЛКА М1 M.A. <...> Друца2 ( 1факультет биоинженерии и биоинформатики МГУ; 2НИИ физико-химической биологии имени А.Н. Белозерского МГУ; e-mail: mak1989@yandex.ru) Вирус гриппа является серьезным патогеном человека, который регулярно вызывает эпидемии, а также пандемии с высоким уровнем смертности. <...> Созданы программы для проведения статистического анализа замен нуклеотидов в кодирующих областях генов, которые были апробированы на большой выборке штаммов вируса гриппа типа А. <...> Внутренние белки вириона оказались эволюционно стабильными, тогда как поверхностные антигены, а также неструктурный белок NS1 — высоковариабельными. <...> Анализ выборки последовательностей матриксного белка М1 показал, что N-домен является крайне консервативным, а М- и С-домены — более изменчивыми. <...> Предсказание внутренней неупорядоченности в пространственной структуре белка М1 по алгоритму DISOPRED выявило высокую структурную пластичность в С-домене. <...> Ключевые слова: вирус гриппа типа А, эволюционная стабильность, вариабельные участки, белок М1. <...> Благодаря быстрому развитию техники секвенирования ДНК в последнее время появились данные о целом ряде геномов различных организмов. <...> Однако часть из них является неаннотированной, что не позволяет оценить эволюционную стабильность белков. <...> Целью работы было создание алгоритма, позволяющего на основании данных о нуклеотидных последовательностях из баз данных судить о вариабельности закодированных в них белков. <...> В качестве объекта для проверки созданного алгоритма использован достаточно хорошо изученный вирус гриппа, принадлежащий семейству оболочечных вирусов Orthomyxoviridae с сегментарным негативным РНК-геномом. <...> В связи с высокой антигенной изменчивостью и способностью к реассортации генов вирус гриппа типа А имеет высокий эпидемический и пандемический потенциал. <...> Материалы и методы Проанализировано около 10 тыс. штаммов вируса гриппа типа А <...>