4 УДК: 575.852.112:575.852.113:577.214:577.217 АНАЛИЗ ВЫРОЖДЕННЫХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫХ МОТИВОВ В ПРОМОТОРАХ ГЕНОВ миРНК, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХСЯ В РАЗЛИЧНЫХ ТКАНЯХ МЛЕКОПИТАЮЩИХ О.В. <...> Березиков1,3 ( 1Институт цитологии и генетики СО РАН, г. Новосибирск; 2кафедра информационной биологии факультета естественных наук Новосибирского государственного университета, г. Новосибирск; 3Hubrecht Institute, RNAAS, Utrecht, Netherlands; е-mail: oleg@bionet.nsc.ru) Разработан метод выявления значимых олигонуклеотидных мотивов в регуляторных районах генов эукариот и проведен компьютерный анализ тканеспецифичных промоторов генов миРНК млекопитающих. <...> МиРНК представляют собой короткие (~22 п.о.) последовательности РНК, способные связываться с 3´-нетранслируемыми районами (3´-НТР) мРНК генов-мишеней, приводя к репрессии трансляции и деградации мРНК. <...> Около 30% генов человека являются мишенями для миРНК [1]. <...> Нарушение экспрессии миРНК приводит к патологиям развития организма и тяжелым заболеваниям. <...> Была показана высокая ткане- и стадиеспецифичность экспрессии миРНК с участием ряда транскрипционных факторов полимеразы II [3]. <...> Выявлено присутствие мотивов канонического ТАТАбокса в 5´-районе миРНК [4]. <...> В то же время остаются до конца не ясными многие особенности организации регуляторных районов генов миРНК, обеспечивающие ткане- и стадиеспецифичность их экспрессии. <...> Задачей исследования было выявление функциональных сигналов в промоторах генов миРНК млекопитающих, экспрессирующихся в различных тканях. <...> Материалы и методы Сформированы выборки регуляторных последовательностей генов миРНК 10 видов млекопитающих (Homo sapiens, Pan troglodytes, Pongo pygmaeus, Gorilla gorilla, Macaca mulatta, Bos taurus, Equus caballus, Canis familiaris, Mus musculus, Rattus norvegicus) в районе [–1000; +1] относительно старта транскрипции, экспрессирующихся в мозге, легких и выделительной системе. <...> Для этого на первом этапе из базы данных Ensembl (http://www.ensembl.org/) была получена информация о локализации в геноме 1572 миРНК человека, предсказанных с использованием различных <...>