| Аннотация | Ген NF1 ( neurofibromin 1) является супрессором опухолей, мутации в котором вызывают развитие нейрофиброматоза 1- го типа и злокачественных опухолей. Анализ научной литературы позволил определить взаимосвязь гена NF1 с ретроэлементами, о чем свидетельствует наличие в геноме человека 12 псевдогенов NF1, расположенных на семи разных хромосомах, поскольку псевдогены образуются с помощью ферментов LINE. Кроме того, интроны гена NF1 содержат полиморфные инсерции Alu, являющиеся причинами повышенной мутабельности гена вследствие рекомбинаций. Ген NF1 также содержит горячие точки инсерционного мутагенеза для LINE и Alu ретроэлементов, а также характеризуется экспрессией нескольких сплайсинговых вариантов, изменения уровней которых в разных тканях и в различные периоды онтогенетического развития могут быть обусловлены взаимосвязями с ретроэлементами, характеризующимися специфичной для различных тканей и органов активацией. Объединенный анализ баз данных MDTE DB и MiRDB позволил выявить 27 произошедших от ретроэлементов микроРНК ( miR- 374c- 5p, - 552- 3p, - 576- 5p, - 582- 5p, - 625- 5p, - 1271- 5p, - 1285- 3p, - 3163, - 3168, - 3617- 5p, - 3681- 3p, - 4452, - 4457, - 4676- 3p, - 4797- 3p, - 4801, - 5003- 3p, - 5584- 5p, - 5684, - 6500- 5p, - 6887- 5p, - 7151- 3p, - 7851- 3p, - 8084, - 9985, - 10523- 5p, - 10524- 5p) , мишенью которых является 3’UTR гена NF1. Это свидетельствует о наличии комплементарных ретроэлементам последовательностей в структуре гена NF1 и о возможности применения микроРНК в качестве объектов для таргетной терапии нейрофиброматоза 1- го типа и злокачественных опухолей с мутациями в гене NF1. Эволюционная взаимосвязь с ретроэлементов может быть причиной функциональности транскриптов гена NF1 и его псевдогенов, одним из проявлений этого является кольцевая РНК circNF1, которая образована из экзонов 2–8 гена NF1. |