На пути к синтетической биологии. Синтетическая биология в лаборатории (4000,00 руб.)

Стр.5

Стр.6

Стр.7

УДК 574.577 ББК 28с К90 К90 На пути к синтетической биологии / пер. с анг. Н. В. Паршиковой. – М.: ДМК Пресс, 2019. – 250 с.: ил. Кулделл Н., Бернштейн Р., Ингрэм К., Харт К. М. ISBN 978-5-97060-668-1 Цель этой книги — рассказать о такой интересной области новых наук, как биотехнологии. Синтетическая биология — наука, которой ещё нет, но основы которой заложены генной инженерией и молекулярной биологией. Излагаются основы биоконструирования, включая иерархию представлений об организации уровней сложности живых систем, рассказывается о роли стандартизации в разработке биосистем и дается несколько примеров стандартизированных методов сборки ДНК. Наряду с изложением теоретических основ в книге подробно описываются лабораторные исследования, каждое из которых начинается с рассмотрения реальной проблемы или разработки конкретной идеи. Авторы показали, как сочетание синтетической биологии с конструированием работает на практике и что можно узнать с помощью инструментов биоинженера. Основной акцент сделан на применение в синтетической биологии некоторых успешных инструментов из более зрелых инженерных дисциплин. Издание рассчитано прежде всего на студентов и аспирантов, обучающихся по специальностям биологического, агрономического, биотехнологического направлений, а также будет интересно всем интересующимся современными биотехнологиями. УДК 574.577 ББК 28с Original English language edition published by O’Reilly Media, Inc. Copyright © 2015 BioBuilder Educational Foundation. Russian-language edition copyright © 2019 by DMK Press. All rights reserved. Все права защищены. Любая часть этой книги не может быть воспроизведена в какой бы то ни было форме и какими бы то ни было средствами без письменного разрешения владельцев авторских прав. ISBN 978-1-491-90429-9 (анг.) ISBN 978-5-97060-668-1 (рус.) Copyright © 2015 BioBuilder Educational Foundation © Оформление, издание, перевод, ДМК Пресс, 2019

Стр.5

Содержание От авторов ...........................................................................................................7 Часть I. ОСНОВЫ СИНТЕТИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ ......................14 Глава 1. Что такое синтетическая биология? ......................................15 Синтетическая биология: возможности и опасения ..........................................16 Синтетическая биология как научно-техническая дисциплина ......................18 Несколько предварительных слов о конструировании инженерных систем .....20 Инструменты синтетической биологии ..............................................................22 Подведем итоги ....................................................................................................30 Дополнительная литература и интернет-ресурсы .............................................31 Глава 2. Основы биологического конструирования .........................32 Иллюстрация поэтапного конструирования ......................................................32 От планирования отдыха к биологическому конструированию .......................34 Общее представление о биологическом конструировании ..............................37 Подведем итоги ....................................................................................................55 Дополнительная литература и интернет-ресурсы .............................................57 Глава 3. Стандартизация и методы конструирования ДНК ..........58 С чего начинать? ...................................................................................................58 Стандартизация формы и размеров ...................................................................60 Конструирование ДНК на практике ....................................................................66 Подведем итоги ....................................................................................................84 Дополнительная литература и интернет-ресурсы .............................................85 Глава 4. Основы биоэтики ...........................................................................86 Что значит «благое дело»? ....................................................................................86 Регламентирование этических исследований ....................................................89 Примеры спорных синтетических биоразработок ...........................................96 Деятельность в области биоэтики .....................................................................102 Дополнительная литература и интернет-ресурсы ...........................................109 Содержание 5

Стр.6

Часть II. ЗНАКОМСТВО С РАБОТАМИ ЛАБОРАТОРИЙ BIOBUILDER .................................................................................................111 Глава 5. Три этапа создания биосистемы............................................112 Глава 6. Улавливаете, чем пахнет? ........................................................115 Вдохновение от проекта Eau d'coli команды iGEM ...........................................116 Дополнительная литература и интернет-ресурсы ...........................................126 «EAU THAT SMELL» (лабораторный практикум) ..............................................127 Глава 7. Как организовано биоустройство iTune .............................139 Модульный принцип конструирования ............................................................141 Технология изолирования .................................................................................143 Основы системы измерений ..............................................................................145 Основные замыслы лабораторного практикума «iTunes Device» ...................149 Дополнительная литература и интернет-ресурсы ...........................................152 iTune device (лабораторный практикум) ...........................................................154 Глава 8. Вы только вообразите это! ......................................................165 Введение в моделирование ................................................................................166 Вдохновение от проекта «Coliroid» команды iGEM ..........................................172 Дополнительная литература и интернет-ресурсы ...........................................178 «Picture This» (лабораторный практикум) .......................................................179 Глава 9. Какой красочный мир! ..............................................................190 Клетка-хозяин, она же – тело-носитель ............................................................191 Справочная информация о проекте «E. Chromi» команды iGEM ....................197 Дополнительная литература и интернет-ресурсы ...........................................201 «What a Colorful World» (лабораторный практикум) ........................................202 Глава 10. Хлеб цвета золота ....................................................................209 Обеспечение технической надежности ............................................................210 История проекта «VitaYeast» команды iGEM ....................................................219 Дополнительная литература и интернет-ресурсы ...........................................224 «Golden bread» (лабораторный практикум) ......................................................225 Приложение А. Лабораторные реагенты и материалы ................233 Словарь терминов ........................................................................................237 Об авторах ......................................................................................................241 Колофон ...........................................................................................................243 Предметный указатель ..............................................................................244 Именной указатель ......................................................................................249 6 Содержание

Стр.7