М.В. Ломоносова, Россия E-mail: karbisheva@mail.ru Поступила в редакцию 15.10.2016 г. Рассмотрены проблемы эволюции цианобактерий с позиций сравнительной филогеномики, включая геобиологические аспекты происхождения этих прокариот, возникновение системы оксигенного фотосинтеза, многоклеточности, диазотрофности. <...> Особое внимание уделено обсуждению вклада различных генетических процессов (мутации, геномные перестройки, редукция геномов, горизонтальный перенос генов) в реализацию путей эволюции геномов цианобактерий. <...> Обобщены закономерности генетической изменчивости, связанные: а) с уровнем генного полиморфизма; б) с экспансией генных семейств; в) с геномными перестройками при участии мобильных элементов. <...> В традиционной классификации (Rippka et al., 1979) было выделено 5 секций (субклассов): I – одноклеточные цианобактерии с бинарным делением; II – одноклеточные с множественным делением; III – многоклеточные, делящиеся линейно в одной проекции; IV – многоклеточные, филаментозные с дифференцированными клетками (вегетативные, гетероцисты, акинеты); V – многоклеточные с ветвящимися филаментами. <...> Внедрение методов молекулярного анализа для определения степени сходства/ различия по генам 16S рРНК и консервативных белков, применение технологий полногеномного секвенирования радикально расширили возможности филогенетических исследований и создали новую биоинформационную платформу для обсуждения путей эволюции микроорганизмов. <...> Таксономия и филогеномные взаимоотношения внутри филума цианобактерий (без определения филогенетических расстояний между ветвями). <...> На основе комплексного полифазного анализа, сочетающего как молекулярно-генетические, так и морфологические и физиолого-экологические критерии, предложена новая версия классификации цианобактерий (Komarek et al., 2014), успешно используемая в изучении процессов эволюции. <...> 1 приведена упрощенная филогенетическая схема взаимоотношений порядков с обозначением <...>