222–225 БИОХИМИЯ, БИОФИЗИКА, МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ УДК 577.112'315.42:577.152.211:576.364 ГЕНОМНОЕ КАРТИРОВАНИЕ БЕЛКОВ ХРОМАТИНА ПРИ ПОМОЩИ МОДИФИКАЦИИ Daminv FLP-ЗАВИСИМОГО МЕТОДА DamID © 2017 г. А. В. Пиндюрин Представлено академиком РАН И.Ф. <...> Жимулевым 08.09.2016 г. Поступило 12.09.2016 г. Для картирования взаимодействий белков хроматина с геномом исследуемого типа клеток, входящих в состав гетерогенных тканей или органов дрозофилы, ранее [4] был разработан FLP-зависимый метод DamID, не требующий сортировки клеток или их ядер. <...> Модифицированный метод был апробирован при определении паттерна взаимодействия белка LAM, являющегося компонентом внутренней мембраны ядерной оболочки, с геномом глиальных клеток мозговых ганглиев личинок дрозофилы. <...> DOI: 10.7868/S0869565217020268 Транскрипционная активность генов в значительной степени определяется составом хроматина [1]. <...> Поэтому для детального понимания механизмов тканеспецифической регуляции генной активности необходимо исследовать паттерны взаимодействия отдельных компонентов хроматина с геномом. <...> В настоящее время картирование сайтов взаимодействия белков хроматина с ДНК генома осуществляют при помощи двух основных методов – ChIP [2] и DamID [3]. <...> Такой белок взаимодействует с теми же участками генома, что и нативный немодифицированный белок, а присоединенный фермент Dam метилирует адениновые основания в близлежащих мотивах GATC генома. <...> Фрагменты ДНК, располагающиеся между двумя соседними метилированными мотивами GATC, могут быть специфически амплифицированы и идентифицированы. <...> Дрозофила является удобным модельным объектом для исследования тканеспецифической регуляции экспрессии генов. <...> Существенно, что этот метод не треNetherlands Cancer Institute, Amsterdam, The Netherlands Институт молекулярной и клеточной биологии Сибирского отделения Российской Академии наук, Новосибирск E-mail: a.pindyurin@mcb.nsc.ru; aleksey.pindyurin@gmail.com бует сортировки отдельных типов клеток. <...> Методика основана на блокировании транскрипции трансгена, кодирующего <...>