1 СРаВНИТЕЛЬНЫЙ аНаЛИЗ ГЕНОМОВ ШТаММОВ ВИРУСа кЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФаЛИТа, ВЫДЕЛЕННЫХ ОТ кОМаРОВ И кЛЕЩЕЙ 1ФКУЗ «Хабаровская противочумная станция» Роспотребнадзора, 680037, г. Хабаровск; 2ФГБУ «Федеральный центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России, ФГБУ «Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины» ФМБА России, 119435, г. Москва 123098, г. Москва; 3 вирус клещевого энцефалита (вКЭ) штамм Лазо MP36 выделен из пула комаров Aedes vexans, отловленных в районе имени Лазо Хабаровского края в августе 2014 г. Филогенетический анализ нуклеотидной последовательности полноразмерного генома штамма Лазо МР36 (номер доступа в genBank KT001073) показал его соответствие дальневосточному типу вКЭ и отличия от штаммов: от клещей Ixodes persulcatus P. schulze, 1930 (вакцинного штамма 205 (JX498939) и выделенных в 2012—2013 гг. штаммов Хехцир 1230 (KF880805), Чичаговка 1222 (KP844724), биробиджан 1354 (KP844726)); от комаров (штамма Малышево, изолированного в 1978 г. от Aedes vexans nipponii (KJ744034), и штамма Сахалин 6-11 сибирского типа вКЭ, выделенного из пула комаров в 2011 г. (KF826916)); из мозга погибших людей (вакцинного штамма Софьин (Kc806252), глубинное/2004 (dQ862460), Кавалерово (FJ402885), Светлогорье (gU121642)). <...> Пептид слияния, необходимый для проникновения флавивирусов в клетки, у трех штаммов вКЭ, выделенных от комаров, — Лазо MP36, Малышево и Сахалин 6-11 — сохранил каноническую структуру 98-drgWgnhcglFgKgsi113 для флавивирусов, переносимых клещами. <...> Аминокислотная замена h104g, типичная для флавивирусов, переносимых комарами, не обнаружена. <...> Последовательности нетранслируемых областей генома штаммов вКЭ от комаров гомологичны на 85—98% штаммам всех типов вКЭ без рекомбинации с флавивирусами, переносимыми комарами и выявляемыми на территории Дальнего востока России. вторичные структуры 5’- и 3’-нетранслируемых областей генома, а также последовательности циклизации типов a и B консервативны у всех изолятов вКЭ вне зависимости от биологических хозяев или переносчиков <...>