Национальный цифровой ресурс Руконт - межотраслевая электронная библиотека (ЭБС) на базе технологии Контекстум (всего произведений: 611760)
Контекстум
Сельскохозяйственная биология  / №3 2016

МОЛЕКУЛЯРНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМА РАС-ДИФФЕРЕНЦИАТОРОВ Phytophthora infestans (140,00 руб.)

0   0
Первый авторСОКОЛОВА
АвторыМОРОЗОВА Е.В., УЛАНОВА Т.И., МАЛЮЧЕНКО О.П., АЛЕКСЕЕВ Я.И., КУЗНЕЦОВА М.А., ХАВКИН Э.Е.
Страниц9
ID457043
АннотацияФитофтороз, возбудителем которого является оомицет Phytophthora infestans (Mont.) de Bary, остается серьезной агрономической и экономической проблемой в картофелеводстве. Традиционная классификация специализированных рас Phytophthora infestans основана на 11 генах устойчивости (R-генах), перенесенных из Solanum demissum в культурный картофель S. tuberosum. Выборку сортов картофеля, каждый из которых несет один из этих R-генов, называют набором растений-дифференциаторов Мастенброка-Блека. Этот набор используют для определения генов вирулентности (r-генов) в изолятах и штаммах P. infestans. Коллекции таких индивидуальных штаммов поддерживают в качестве рас-дифференциаторов для выявления R-генов у культурных и дикорастущих растений Solanum. Хотя расы-дифференциаторы широко применяются в селекции картофеля на устойчивость к фитофторозу, они все еще недостаточно исследованы молекулярными методами. В настоящей работе мы изучали полиморфизм рас-дифференциаторов Phytophthora infestans, поддерживаемых в коллекции Всероссийского НИИ фитопатологии (Московская обл.). Для этого расы исследовали методом микросателлитного анализа по 12 геномным локусам; кроме того, провели сравнительный структурный анализ трех Avr генов, клонированных после ПЦР-амплификации геномной ДНК P. infestans. Геномную ДНК выделяли из 11 простых и сложных рас (1; 3; 4; 10; 11; 1.2; 1.3; 1.4; 1.2.3; 1.2.4; 1.2.3.4) и изолята 161, который содержал все 11 генов вирулентности. Нуклеотидные последовательности трех Avr генов депонировали в GenBank NCBI (National Center for Biotechnology Information, США) и сопоставили с другими хранящимися в нем последовательностями. Генотипирование рас-дифференциаторов P. infestans показало, что они резко отличаются от референтных A1 штаммов и высокоагрессивных линий, доминировавших в последние годы в Западной и Центральной Европе. SSR кластеры расдифференциаторов не согласовались с профилями r-генов. Гены ipiO (распознаются геном устойчивости RB/Rpi-blb1 растений S. bulbocastanum и его ортологом Rpi-sto1 S. stoloniferum), а также Avr3a и Avr4 (соответствуют генам R3a и R4 S. demissum) были обнаружены во всех исследованных изолятах P. infestans. Каждый ген был представлен несколькими аллелями. Сложный состав Avr генов противоречит традиционным представлениям о «простых» моногенных расах. В случае ipiO (номера последовательностей в GenBank KP308170KP308174, KF154431-KF154433 и KF154434-KF154439) раса 1 была представлена аллелями I и II классов, в то время как расы 3 и 4 содержали только гены I класса. Ни в одной из этих рас не был обнаружен ген ipiO наиболее вирулентного III класса. Вирулентный аллель Avr3a_EM был найден у всех исследованных рас, а авирулентный аллель Avr3а_KI — только у рас 1, 3 и 1.2.3 (номера последовательностей KF154421-KF154426, KF154430, KP317568, KP317572, KP317580-KP317584, KP317588, KP317589). Ген Avr4 клонировали из рас-дифференциаторов 1, 3, 1.4 и 11 (KF188215-KF188223). Все эти расы содержали вирулентный аллель, а раса 11 несла вирулентный и авирулентный аллели. Результаты молекулярного и фитопатологического анализа Avr и r генов сходились лишь у 30 % рас. Причинами этих расхождений могли стать накопление мутаций в Avr генах рас-дифференциаторов в процессе их длительного поддержания в коллекции и более сложный состав R генов у растений-дифференциаторов, на которых эти расы изначально отбирались.
УДК635.21:632.4:582.281.144:577.21
МОЛЕКУЛЯРНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМА РАС-ДИФФЕРЕНЦИАТОРОВ Phytophthora infestans / Е.А. СОКОЛОВА [и др.] // Сельскохозяйственная биология .— 2016 .— №3 .— С. 110-118 .— URL: https://rucont.ru/efd/457043 (дата обращения: 19.05.2025)

Предпросмотр (выдержки из произведения)

2016.3.376rus МОЛЕКУЛЯРНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМА РАС-ДИФФЕРЕНЦИАТОРОВ Фитофтороз, возбудителем которого является оомицет на 11 генах устойчивости ( фель  Е. <...> Традиционная классификация специализированных рас -генах), перенесенных из . <...> Выборку сортов картофеля, каждый из которых несет один из этих -генов) в изолятах и штаммах в культурный карто-генов, называют набором растений-дифференциаторов Мастенброка-Блека. <...> Этот набор используют для определения генов вирулентности ( -генов у культурных и дикорастущих растений . <...> Коллекции таких индивидуальных штаммов поддерживают в качестве рас-дифференциаторов для выявления . <...> . Для этого расы исследовали методом микросателлитного анализа по 12 геномным локусам; кроме того, провели сравнительный структурный анализ трех номной ДНК . <...> SSR кластеры расдифференциаторов не согласовались с профилями / генов. <...> Каждый ген был представлен несколькими аллелягенов противоречит традиционным представлениям о «простых» (номера последовательностей в GenBank KP308170KP308174, KF154431-KF154433 и KF154434-KF154439) раса 1 была представлена аллелями I и II классов, в то время как расы 3 и 4 содержали только гены I класса. <...> Ни в одной из этих рас не был обнаружен ген был найден у всех исследованных рас, а авирулентный аллель наиболее вирулентного III класса. <...> Все эти расы содержали вирулентный аллель, а раса 11 несла вирулентный и авирулентный аллели. <...> Результаты молекулярного и фитопатологического анализа ждений могли стать накопление мутаций в длительного поддержания в коллекции и более сложный состав ференциаторов, на которых эти расы изначально отбирались. <...> Причинами этих расхогенах рас-дифференциаторов в процессе их генов у растений-дифгены, микросателлитные (SSR) маркеры. <...> Фитофтороз, возбудителем которого является оомицет (Mont.) de Bary, остается одной из самых серьезных агрономических и экономических проблем в картофелеводстве (1-3). <...> Сведения об этой болезни, полученные фитопатологическими методами (1), в последние <...>