IT в естественных науках Биоинженерные технологии ПРИКЛАДНАЯ ИНФОРМАТИКА № 5 (41) 2012 Ю. М. Суворова, аспирант Центра «Биоинженерия» РАН, г. Москва М. А. <...> Коротков, докт. биол. наук, профессор Центра «Биоинженерия» РАН, г. Москва Изучение точек разладки триплетной периодичности в нуклеотидных последовательностях генов Задача разбиения неоднородной последовательности или временного ряда точками, разделяющими однородные участки, впервые возникла в контексте контроля качества на производстве и получила название задачи о разладке (change point problem). <...> Она оказалась актуальной для самых различных областей, таких как контроль качества, оценка надежности, эконометрика и медицина, так как точки разладки отражают внутренние изменения исследуемых процессов. <...> В результате возникла задача разбиения последовательности ДНК на однородные участки, для чего были применены некоторые методы из теории поиска точек разладки (ТР) [3]. <...> Основным объектом данной работы явП ляются последовательности ДНК, которые кодируют белки. <...> Ген кодирует аминокислотную последовательность белка тандемными триплетами, называемыми кодонами, всего существует 64 различных кодона. <...> Последовательность кодонов транслируется в аминокислоты в соответствии с действующей рамкой считывания, всего есть три возможных рамки [5]. <...> Разнообразие белков может быть результатом рекомбинации доменов, осуществляющейся путем так называемых склеек (часть одного гена присоединяется к другому, образуя новую последовательность) [7] или вставок (когда часть «чужого» гена вставляется внутрь родительской последовательности). <...> Установлено, что кодирующие последовательности всех живых организмов обла75 Биоинженерные технологии Ю. М. Суворова, М. А. Короткова, Е. В. Коротков № 5 (41) 2012 дают свойством триплетной периодичности (ТП) [8–9]. <...> Классификационный анализ показал, что ТП большинства известных кодирующих последовательностей принадлежит одному из 2500 различных классов <...>