3, № 2 Ярославской и Костромской областей, а также участки ЦНС погибших больных из Ярославской области. <...> Для изучения структуры популяции возбудителя КЭ в Ярославской области исследована коллекция штаммов ВКЭ, созданная в ИПВЭ им. <...> М.П. Чумакова, а также штаммы ВКЭ, выделенные в период исследований. <...> Детекцию ВКЭ в материале проводили методом ОТ-ПЦР в режиме реального времени с гибридизационно-флуоресцентной детекцией с генотипспецифическими зондами. <...> На территории Ярославской области впервые проведен мониторинг структуры популяции ВКЭ за 1983–2012 гг. <...> Осуществлен анализ хронологических рядов штаммов, выделенных на территории региона из клещей и от больных людей, генотипированы 35 штаммов и изолятов РНК ВКЭ. <...> Период 1990–1993 гг. характеризовался выделением политиповых штаммов ВКЭ, содержащих фрагменты геномов дальневосточного и сибирского подтипов ВКЭ. <...> Начиная с 1998 г. из клещей, а также от больных и умерших людей выделялись штаммы и изоляты РНК только сибирского подтипа ВКЭ. <...> Данный подтип выделен от 9 умерших больных на территории области за период 2001–2012 гг. <...> . РНК ВКЭ выявлена в различных участках головного и в шейном отделе спинного мозга. <...> В клещах I. persulcatus, собранных в природных стациях на территории Ярославской области за 2009–2011 гг., обнаружены такие клещевые патогены, как боррелии (B.b.s.l), эрлихии, анаплазмы. <...> Впервые установлена циркуляция сибирского подтипа вируса на данной территории. <...> В остальных пробах ВКЭ генотипировать не удалось. <...> Таким образом, показано, что за 30-летний период на территории Ярославской области произошло изменение генетической структуры популяции ВКЭ — исключение дальневосточного подтипа и абсолютное доминирование сибирского подтипа. <...> Расширены представления о распространении последнего на территории ЦФО России (Костромская область). <...> Выявлена циркуляция 3-х бактериальных клещевых патогенов (боррелии, анаплазмы, эрлихии) на территории ЦФО. <...> ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ <...>