2015.6.803rus ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ РОССИЙСКИХ ИЗОЛЯТОВ ВИРУСА ИНФЕКЦИОННОЙ АНЕМИИ ЛОШАДЕЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ОПТИМИЗИРОВАННОЙ ДВУХРАУНДОВОЙ ПЦР Н.Н. <...> ГЕРАСИМОВА, О.Л. КОЛБАСОВА, С.Ж. ЦЫБАНОВ, Д.В. КОЛБАСОВ Инфекционная анемия лошадей (ИНАН) — болезнь однокопытных, вызываемая вирусом рода семейства . <...> В Российской Федерации из года в год при плановых исследованиях на присутствие антител к вирусу ИНАН выявляются животные, серопозитивные в реакции диффузионной преципитации (РДП). <...> В настоящей работе представлены данные по разработке тестсистемы на основе ПЦР, позволяющей не только выявлять геном вируса ИНАН в различных образцах биологического материала, но и проводить дальнейшее секвенирование фрагментов генома этого инфекционного агента. <...> Геном вируса ИНАН состоит из трех основных генов — (распложены в направлении 53), из которых наиболее полезным маркером , , для изучения генетического разнообразия и филогенетических взаимоотношений между различными штаммами вируса ИНАН считается -ген, необходимый для внутриклеточной сборки и выхода вируса из клетки. <...> С целью проведения молекулярно-генетических исследований нами была оптимизирована двухраундовая ПЦР без этапа обратной транскрипции и рассчитаны специфические олигонуклеотидные праймеры для второго раунда реакции, фланкирующие участок -гена провирусной ДНК вируса ИНАН размером 1018 п.н. <...> В результате проведенных изысканий также были определены нуклеотидные последовательности и филогенетические отношения ранее выделенного отечественного штамма вируса ИНАН и двух современных изолятов, выявленных на территории нашей страны. <...> Полученные данные позволили отнести штамм 3-К-ВНИИТИБП-ВИЭВ к группе североамериканского происхождения (гомология 98 %), а изоляты Нижний Новгород-2011 и Омск-2012 — к группе европейских (гомология 82-83 %). <...> Таким образом, разработанная нами система идентификации вируса ИНАН с помощью ПЦР и филогенетического анализа позволяет <...>