2015.3.332rus АНАЛИЗ ГЕНОВ «ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА» И ВИРУЛЕНТНОСТИ У КОММЕРЧЕСКИХ ШТАММОВ ДЕЙСТВИЕМ В.И. САФРОНОВА, А.Л. САЗАНОВА, И.Г. КУЗНЕЦОВА, Ж.П. ПОПОВА, С.Д. ГРИШЕЧКИНА, В.П. ЕРМОЛОВА, Е.Е. АНДРОНОВ значения (ВКСМ) поддерживает 37 штаммов Ведомственная коллекция полезных микроорганизмов сельскохозяйственного наобладающих выраженной энтомоцидной активностью и используемых для производства препаратов фитозащитного действия (битоксибациллин, бактокулицид, бацикол). <...> Эффективность производимых биопрепаратов зависит от качества микробного материала. <...> В настоящее время наиболее эффективной технологией доскональной генетической характеристики штаммов микроорганизмов считается полногеномное секвенирование. <...> Однако, несмотря на несомненную востребованность полногеномного секвенирования для паспортизации коммерческих штаммов, ее широкое применение ограничивается значительной трудозатратностью и себестоимостью. <...> Поэтому для удешевления анализа и сокращения сроков его выполнения необходима разработка экспресс-методов высокопроизводительного секвенирования. <...> Одним из решений может быть анализ не всего генома, а наиболее таксономически и функционально значимых генетических локусов (так называемого референт-комплекса). <...> Целью нашей работы стало выявление референт-комплексов у 10 штаммов разных серотипов. <...> После проведения высокопроизводительного пиросеквенирования штаммов и получения полногеномных последовательностей был проведен их сравнительный анализ и найдены наиболее дивергентные генетические локусы, определяющие уникальность штаммов. <...> Использовали программу BioNumerics («Applied Maths», США); для построения дендрограмм, отражающих филогенетическое родство между исследуемыми штаммами, суммы последовательностей отобранных генов «домашнего хозяйства» и отдельно генов вирулентности обрабатывали с помощью программы MEGA v. <...> Для каждого штамма сконструированы два референткомплекса, представляющих <...>