Национальный цифровой ресурс Руконт - межотраслевая электронная библиотека (ЭБС) на базе технологии Контекстум (всего произведений: 635051)
Контекстум
Руконтекст антиплагиат система
Сельскохозяйственная биология  / №1 2015

ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ СОВРЕМЕННЫХ СОРТОВ ЯБЛОНИ (Malus Ѕ domestica Borkh.) ОТЕЧЕСТВЕННОЙ СЕЛЕКЦИИ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ ЛОКУСОВ (130,00 руб.)

0   0
Первый авторСупрун
АвторыУшакова Я.В., Токмаков С.В., Дюрель Ч.Э., Денанс К., Ульяновская Е.В.
Страниц9
ID410369
АннотацияМикросателлитные ДНК-маркеры, основанные на анализе простых повторяющихся повторов (SSR — simple sequence repeats), признаются одной из наиболее эффективных ДНКмаркерных систем, используемых в селекции и генетике культурных растений. С помощью SSR-маркеров были построены первые наиболее насыщенные генетические карты яблони. Кроме того, выполнен широкий перечень исследований, направленных на изучение генетического разнообразия в коллекциях сортов, диких форм, межвидовых гибридов яблони. C целью изучения генетической структуры рабочей коллекции современных сортов яблони отечественной селекции был оценен полиморфизм 12 микросателлитных локусов в выборке из 31 сорта яблони селекции Северо-Кавказского зонального НИИ садоводства и виноградарства (СКЗНИИСиВ, г. Краснодар) и Всероссийского НИИ селекции плодовых культур (ВНИ- ИСПК, г. Орел) из коллекции генетических ресурсов СКЗНИИСиВ. Использовали SSRмаркеры, рекомендованные Европейским консорциумом Fruitbreedomics для изучения генетического разнообразия яблони: CH01f03b, CH01h01, CH01h10, CH02c06, CH02d08, CH04e05, CH05f06, CH01f02, CH02c11, Hi02c07, CH02c09 и CH03d07. По данным SSRанализа был выявлен уровень полиморфизма от 5 до 10 аллелей на локус (наибольший — по CH02c11, наименьший — по CH01f03b) при среднем значении 7,75 аллеля на локус. Суммарно по 12 проанализированным локусам идентифицировали 93 аллеля. Все изученные сорта обладали уникальным набором аллелей. Сравнение с данными о генетическом разнообразии мирового генофонда яблони позволяет утверждать, что изученная выборка современных сортов яблони отечественной селекции характеризуется высоким уровнем полиморфизма SSR-локусов. Величины ожидаемой (He) и наблюдаемой (Ho) гетерозиготности варьировали в пределах 0,548-0,897 для Ho и 0,602-0,827 для He при среднем показателе Ho = 0,786 и He = 0,755. Значение PIC (polymorphism information content) составило от 0,571 до 0,806. При этом по 9 локусам из 12 изученных названный показатель изменялся в пределах 0,712-0,806. Результаты UPGMAанализа согласуются с данными по генетической разнородности сортов из изученной выборки. Построение дендрограммы позволило выделить пять основных кластеров. Распределение сортов по кластерам в большинстве случаев прямо соотносится с их генеалогией. Так, сорт Свежесть, вошедший в отдельный кластер № 1, и сорта Имрус и Зимнее утро, сформировавшие кластер № 5, происходят от сортов, не представленных в родительских формах ни у одного из остальных сортов в изученной выборке. Сорта Солнышко, Строевское, Юбилей Москвы, Афродита и Старт селекции ВНИИСПК, выделенные в кластер № 3, имеют одну общую родительскую форму. Cложная структура дендрита, полученная при выполнении кластеризации по результатам SSR-анализа, может быть следствием большого числа уникальных аллелей у изучаемых генотипов, что, в свою очередь, обусловлено высоким уровнем генетического разнообразия внутри выборки. В то же время факт объединения сортов с одинаковой генеалогией в одни кластеры подтверждает значительное генетическое сходство внутри групп таких сортов. Результаты исследования дают возможность оценить уровень генетического полиморфизма в изученной выборке, кроме того, данные SSR-генотипирования могут быть использованы в дальнейшем для подтверждения генеалогии сортов и гибридов при возникновении спорных вопросов, а также при сортовой идентификации.
УДК634.11:575.174.015.3:577.21
ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ СОВРЕМЕННЫХ СОРТОВ ЯБЛОНИ (Malus Ѕ domestica Borkh.) ОТЕЧЕСТВЕННОЙ СЕЛЕКЦИИ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ ЛОКУСОВ / И.И. Супрун [и др.] // Сельскохозяйственная биология .— 2015 .— №1 .— С. 38-46 .— URL: https://rucont.ru/efd/410369 (дата обращения: 04.05.2024)

Предпросмотр (выдержки из произведения)

2015.1.37rus ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ СОВРЕМЕННЫХ СОРТОВ ЯБЛОНИ (Malus ½ domestica Borkh.) <...> УЛЬЯНОВСКАЯ1 Микросателлитные ДНК-маркеры, основанные на анализе простых повторяющихся повторов (SSR — simple sequence repeats), признаются одной из наиболее эффективных ДНКмаркерных систем, используемых в селекции и генетике культурных растений. <...> Кроме того, выполнен широкий перечень исследований, направленных на изучение генетического разнообразия в коллекциях сортов, диких форм, межвидовых гибридов яблони. <...> C целью изучения генетической структуры рабочей коллекции современных сортов яблони отечественной селекции был оценен полиморфизм 12 микросателлитных локусов в выборке из 31 сорта яблони селекции Северо-Кавказского зонального НИИ садоводства и виноградарства (СКЗНИИСиВ, г. Краснодар) и Всероссийского НИИ селекции плодовых культур (ВНИИСПК, г. Орел) из коллекции генетических ресурсов СКЗНИИСиВ. <...> По данным SSRанализа был выявлен уровень полиморфизма от 5 до 10 аллелей на локус (наибольший — по CH02c11, наименьший — по CH01f03b) при среднем значении 7,75 аллеля на локус. <...> Все изученные сорта обладали уникальным набором аллелей. <...> Сравнение с данными о генетическом разнообразии мирового генофонда яблони позволяет утверждать, что изученная выборка современных сортов яблони отечественной селекции характеризуется высоким уровнем полиморфизма SSR-локусов. <...> Значение PIC (polymorphism information content) составило от 0,571 до 0,806. <...> Результаты UPGMAанализа согласуются с данными по генетической разнородности сортов из изученной выборки. <...> Построение дендрограммы позволило выделить пять основных кластеров. <...> Распределение сортов по кластерам в большинстве случаев прямо соотносится с их генеалогией. <...> Так, сорт Свежесть, вошедший в отдельный кластер ¹ 1, и сорта Имрус и Зимнее утро, сформировавшие кластер ¹ 5, происходят от сортов, не представленных в родительских формах ни у одного из остальных сортов в изученной выборке. <...> Сорта Солнышко, Строевское, Юбилей <...>