Национальный цифровой ресурс Руконт - межотраслевая электронная библиотека (ЭБС) на базе технологии Контекстум (всего произведений: 634699)
Контекстум
.
Молекулярная генетика, микробиология и вирусология  / №2 2016

ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ИЗОЛЯТОВ МИКОБАКТЕРИЙ ТУБЕРКУЛЕЗА ИЗ Республики САХА (ЯКУТИЯ), РОССИЯ (250,00 руб.)

0   0
Первый авторЖданова
АвторыОгарков О.Б., Алексеева Г.И., Винокурова М.К., Синьков В.В., Астафьев В.А., Савилов Е.Д., Кравченко А.Ф.
Страниц6
ID399253
АннотацияМетодом MIRU-VNTR-генотипирования по 24 локусам оценена популяционная структура M. tuberculosis в Республике Саха (Якутия). Исследовано 199 штаммов, выделенных от 199 больных туберкулезом легких. Наибольшее количество штаммов — 34,2% (68/199) принадлежало генотипу Beijing. Среди изолятов генотипа Beijing выявлено значимое преобладание (χ = 15,5; p < 0,001) множественной и широкой лекарственной устойчивости (MDR/XDR) у субтипа CC2/W148 — 9,5% (19/199). Штаммы генотипа S — 15,6% (31/199) были вторыми по распространенности после генотипа Beijing. Большинство S-штаммов имели идентичный профиль 233325153325141344222372. Штаммы генотипа S значимо чаще несли MDR или XDR (χ= 59,8; p < 0,001) среди non-Beijing изолятов. Штаммы генотипа Ural занимали третье место по распространенности — 10,0% (20/199). К семейству LAM относилось 8,5% (17/199) штаммов, отличавшихся значительной генетической гетерогенностью. Также большим генетическим разнообразием отличались минорные генотипы Т и Haarlem. Проведено филогенетическое моделирование заноса МБТ эпидемических генотипов S и субтипа CC2/W148 генотипа Beijing на территорию Республики Саха (Якутия) с оценкой вероятного времени по шкале, предложенной M. Merker и соавт. (2015). Показано, что штаммы субтипа CC2/W148 принадлежат 4 филогенетическим сублиниям и занесены на изучаемую территорию в исторически недавние сроки, то есть в XX веке. Проведена оценка филогенетических взаимоотношений 30 MIRU-VNTRпрофилей штаммов S-семейства из Республики Саха (Якутия) и 31 референсного S-профиля от штаммов из Европы и Канады. Профили генотипа S из Республики Саха (Якутия) образуют филогенетически компактную группу, свидетельствующую о том, что вся эволюционная история этих штаммов прошла на территории этой республики. Время заноса предкового генотипа S на территорию Якутии оценено диапазоном 300—600 лет.
УДК579.873.21:579.25
ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ИЗОЛЯТОВ МИКОБАКТЕРИЙ ТУБЕРКУЛЕЗА ИЗ Республики САХА (ЯКУТИЯ), РОССИЯ / С.Н. Жданова [и др.] // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология .— 2016 .— №2 .— С. 5-10 .— URL: https://rucont.ru/efd/399253 (дата обращения: 24.04.2024)

Предпросмотр (выдержки из произведения)

Синьков В.В., ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ИЗОЛЯТОВ МИКОБАКТЕРИЙ ТУБЕРКУЛЕЗА ИЗ РЕСПУБЛИКИ САХА (ЯКУТИЯ), РОССИЯ 1ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека», 664003, Иркутск, Россия; 2 ский государственный университет» 664003, Иркутск, Россия; 3 последипломного образования», 664079, Иркутск, Россия; 4 p < 0,001) множественной и широкой лекарственной устойчивости (MDr/XDr) у субтипа CC2/W148 — 9,5% (19/199). <...> Штаммы генотипа s значимо чаще несли MDr или XDr (χ2 = 15,5; Методом MirU-Vntr-генотипирования по 24 локусам оценена популяционная структура M. tuberculosis в Республике Саха (Якутия). <...> Среди изолятов генотипа Beijing выявлено значимое преобладание (χ2 ГБО ДПО «Иркутская государственная медицинская академия ГБУ РС (Я) НПЦ «Фтизиатрия», 677015, Якутск, Россия; в соответствии с новой классификацией, приведенной в статье [3], проводится сравнительная оценка времени заноса штаммов основных эпидемических сублиний МБТ на исследуемую территорию. <...> Настоящее исследование одобрено Этическим комитетом ФГБНУ НЦ ПЗСРЧ. <...> Штаммы генотипа Ural занимали третье место по распространенности — 10,0% (20/199). <...> К семейству lAM относилось 8,5% (17/199) штаммов, отличавшихся значительной генетической гетерогенностью. <...> Также большим генетическим разнообразием отличались минорные генотипы Т и haarlem. <...> Проведено филогенетическое моделирование заноса МБТ эпидемических генотипов s и субтипа CC2/W148 генотипа Beijing на территорию Республики Саха (Якутия) с оценкой вероятного времени по шкале, предложенной M. <...> . Показано, что штаммы субтипа CC2/W148 принадлежат 4 филогенетическим сублиниям и занесены на изучаемую территорию в исторически недавние сроки, то есть в XX веке. <...> Профили генотипа s из Республики Саха (Якутия) образуют филогенетически компактную группу, свидетельствующую о том, что вся эволюционная история этих штаммов прошла на территории этой республики. <...> Время заноса предкового генотипа s на территорию Якутии оценено диапазоном 300—600 лет. <...> На данный момент опубликовано <...>