Исходя из этого факта можно предположить, что в субтипе gagA/envB, для которого выявлена большая частота мутаций в регуляторных генах, при лечении также быстрее образуются мутации и в структурных генах (gag, pol и env), ведущие к появлению вариантов, устойчивых к антиретровирусным препаратам. <...> 6 Детекция потенциальных сайтов рекомбинации вируса клещевого энцефалита методами сравнительной геномики 1ФГБОУ ВПО «Иркутский государственный медицинский университет» Минздрава РФ, 664025, г. Иркутск; 2 проблем здоровья семьи и репродукции человека» СО РАМН, 664003, г. Иркутск; 3 институт СО РАН, 664082, г. Иркутск; 5 Университет Претории, ЮАР; 4 6Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, 630090, г. Новосибирск Представлены результаты биоинформационного поиска потенциальных сайтов рекомбинации в полногеномных структурах вируса клещевого энцефалита (вКЭ) с помощью ряда программных методов. <...> Рекомбинантные штаммы относились к дальневосточному (n = 19) и европейскому (n = 2) генотипам. выявленные 22 сайта рекомбинации отнесены к 5 типам по позиционным, штаммовым и региональным характеристикам. <...> Определены родительские штаммы, которые по генотипическим и географическим параметрам не противоречат возможности формирования рекомбинантов. <...> Почти ⅔ сайтов расположены в области генов ns4a и ns4b штаммов вКЭ, являющейся «горячей точкой» рекомбинации, при этом большая их часть концентрируется в гене ns4. <...> Показано, что рекомбинационные процессы у вКЭ происходят на уровне генотипа (европейского), определенных групп внутри генотипа (дальневосточного) и характерны для периферийных популяций ареала. <...> Ключевые слова: вирус клещевого энцефалита; сайты рекомбинации; методы программирования рекомбинации; родительские штаммы; «горячая точка» рекомбинации. <...> 6 Detection of potential sites of recombination in the Tick-borne encephalitis virus by the methods of comparative genomics 1Irkutsk State Medical University, Ministry of Health of the Russian Federation, 664025, Irkutsk, Russia; 2 University of Pretoria, South Africa; 4 of Sciences, 664082, Irkutsk, Russia; 5 <...>