Увидеть больше видимого: компьютерный анализ изображений в биологии Доктор биологических наук Е.О.Пучков, Институт биохимии и физиологии микроорганизмов РАН Как компьютер может помочь биологу в работе с видимыми глазом объектами? <...> Возьмем для начала такую задачу, как учет большого количества объектов с определенными оптическими свойствами — например, колоний микроорганизмов на чашках Петри (рис. <...> Эти цилиндрические блюдечки, или чашки, изобрел немецкий микробиолог Юлиус Петри (1852—1921), ассистент Роберта Коха. <...> Он же в 1877 году разработал методику выращивания в них микробных клеток на поверхности или в толще плотной гелеобразной питательной среды до тех пор, пока колонии не станут видны невооруженным глазом. <...> Каждая колония — потомки одной бактерии, и таким образом, например, можно прикинуть, сколько их было в растворе, из которого делали посев. <...> Анализы на чашках Петри сравнительно просты, но трудоемки, длительны, а главное, субъективны. <...> Чтобы ускорить анализы и сделать их более объективными, созданы компьютерные счетчики-анализаторы колоний, основные элементы которых — цифровая видеокамера, осветители и компьютер с соответствующим программным обеспечением (рис. <...> Поэтому в самом начале компьютер обучают распознавать колонии — например, по оптической плотности их изображений. <...> Если в качестве критерия различий взять цвет, то можно расщепить изображения на первичные цвета: красный — синий — зеленый (рис. <...> Похожим образом программа обучается по форме и размерам колоний, а также по их различным сочетаниям. <...> 2 Компьютерные счетчики-анализаторы колоний микроорганизмов: вверху— Компанкол-М1 («Набитех», Россия), внизу — Sorcerer («Perceptive Instruments», Великобритания) Программы компьютерных счетчиков-анализаторов колоний способны также измерять линейные размеры и площади выделенных на изображении структур. <...> Внешний вид колоний — один из признаков, который используют для таксономической характеристики микроорганизмов <...>