МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РФ
ГОСУДАРСТВЕННОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ
УЧРЕЖДЕНИЕ
ВЫСШЕГО ПРОФЕССИОНАЛЬНОГО ОБРАЗОВАНИЯ
«ВОРОНЕЖСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ
УНИВЕРСИТЕТ»
ЭВОЛЮЦИЯ ГЕНОМА И КОЭВОЛЮЦИЯ
ГЕНЕТИЧЕСКИХ СИСТЕМ
Учебное пособие
Составители: <...> Е.В. Богданова
Издательско-полиграфический центр
Воронежского государственного университета
2010
Утверждено научно-методическим советом биолого-почвенного факультета 12 ноября 2009 г., протокол № 3
Рецензент д-р биол. наук В.А. Агафонов
Учебное пособие подготовлено на кафедре генетики, цитологии и
биоинженерии биолого-почвенного факультета Воронежского государственного университета. <...> Различия между надцарствами прокариот и эукариот ........... 10 <...> Поддержание постоянства кариотипа в ряду поколений
клеток и рекомбинация наследственного материала . <...> Горизонтальный перенос детерминант устойчивости
к соединениям ртути в природных популяциях бактерий ............ 61 <...> Коэволюция организмов, находящихся в антогонистических
отношениях (на примере сопряженной эволюции растенияхозяина и патогена). <...> Эти представления методологически подготовлены
исследованием экологической устойчивости и пластичности видов и
популяций, в их отношении к эволюционным преобразованиям, идеей коэволюции: от внутригеномных корреляций до сопряженной
эволюции видов в симбиотических системах. <...> В мире прокариот черты симбиогенеза широко распространены вплоть до горизонтального переноса генов. <...> Закономерности
сопряженной эволюции организмов в экосистемах изучены еще недостаточно (Инге-Вечтомов, 2009). <...> Бурное развитие новых научных направлений в биологии вызвало необходимость подготовки учебного пособия по эволюции
генома и коэволюции генетических систем – одному из разделов
курса «Современные проблемы эволюционной теории», читаемого
бакалаврам биолого-почвенного факультета ВГУ. <...> Геном, по
определению Жимулева (2003), – это вся ДНК в гаплоидном наборе
хромосом данного вида. <...> Клаг и Каммингс <...>
Эволюция_генома_и_коэволюция_генетических_систем.pdf
МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РФ
ГОСУДАРСТВЕННОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ
УЧРЕЖДЕНИЕ
ВЫСШЕГО ПРОФЕССИОНАЛЬНОГО ОБРАЗОВАНИЯ
«ВОРОНЕЖСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ
УНИВЕРСИТЕТ»
ЭВОЛЮЦИЯ ГЕНОМА И КОЭВОЛЮЦИЯ
ГЕНЕТИЧЕСКИХ СИСТЕМ
Учебное пособие
Составители:
М.Н. Назарова,
Е.В. Богданова
Издательско-полиграфический центр
Воронежского государственного университета
2010
Стр.1
СОДЕРЖАНИЕ
Введение ...............................................................................................5
1. Сходство основных процессов жизнедеятельности
у представителей органического мира .......................................6
2. Основные концепции происхождения клеток эукариот .........7
2.1. Методологическая основа аутогенной
и симбиотической концепции .........................................................7
2.2. История развития симбиотической концепции ......................7
2.3. Экспериментальное подтверждение возможности
симбиотического происхождения эукариотической клетки
и слабые места этой концепции ......................................................8
3. Прокариоты и эукариоты как представители двух
надцарств живой природы ............................................................10
3.1. Различия между надцарствами прокариот и эукариот ...........10
3.2. Прокариоты и эукариоты – разные линии эволюции ............12
3.3. Типы корреляций и их роль в усложнении
организации эукариот ......................................................................13
4. Многоуровневая организация генома эукариот .......................14
4.1. Генный уровень .........................................................................14
4.1.1. Гены и регуляция их экспрессии .......................................14
4.1.2. Генные мутации ...................................................................19
4.2. Хромосомный уровень организации
генетического материала .................................................................20
4.2.1. Хромосома как эволюционно сложившаяся структура .......20
4.2.2. Структурные перестройки хромосом ................................23
4.3. Геномный уровень организации генетического материала ......28
4.3.1. Понятие о генотипе, норме реакции и модификационной
изменчивости .................................................................................28
4.3.2. Экспрессивность и пенетрантность ...................................31
4.3.3. Поддержание постоянства кариотипа в ряду поколений
клеток и рекомбинация наследственного материала . ................32
4.3.4. Геномные мутации ..............................................................34
4.3.5. В-хромосомы эукариот, их структурные
и функциональные особенности, механизмы
возникновения и роль в эволюции ...............................................36
4.3.5.1. Морфологические особенности B-хромосом,
их число и поведение при клеточном делении .....................36
3
Стр.3
1. Сходство основных процессов жизнедеятельности
у представителей органического мира
Проблема прогрессивного развития органического мира (арогенез)
является одной из центральных в современной биологии. Особое
место в проблеме прогресса принадлежит вопросу об усложнении организации.
Так, например, в процессе эволюции происходило изменение
генома. Геном является информационным центром всего живого.
Он представляет собой совокупность генов гаплоидного набора хромосом
данного вида, включая как кодирующие, так и некодирующие
последовательности ДНК с неизвестными пока функциями. Геном, по
определению Жимулева (2003), – это вся ДНК в гаплоидном наборе
хромосом данного вида. Клаг и Каммингс (2007) рассматривают геном
как совокупность всех генов данной особи.
Изменения генома привели к появлению живых существ разной
степени организации. Предполагается, что все организмы в процессе
эволюции произошли от общей предковой клетки. Это проявляется:
• в единстве элементарного состава живых организмов;
• в единстве типа химических связей (нуклеиновые кислоты,
белки, углеводы, липиды);
• в единстве мембранного типа строения субклеточных органелл;
• в единстве генетического кода;
• в сходстве процесса репликации;
• связь информационной РНК с рибосомами в процессе синтеза
белка тоже универсальна;
• все изученные организмы используют аденозинтрифосфат
(АТФ) в реакциях, требующих затраты энергии.
На основе сравнения геномов различных организмов было обнаружено,
что существует фундаментальный набор генов (ортологичные
гены), белковые продукты которых легко распознаются у
про- и эукариот. Эти гены произошли от общего предшественника и
сохранили свои функции в процессе эволюции. Паралогичные гены
произошли в результате геномных дупликаций и их функции
дивергировали в процессе эволюции.
В эволюции жизни удивительным является то, как быстро она
происходила. Примерно через миллиард лет после образования нашей
планеты на ней уже возникли одноклеточные формы жизни (клетки
6
Стр.6
появились 3,5–4,0 млрд лет назад). Появление эукариот произошло
приблизительно 1,5 млрд лет назад. Это очень важное событие на
эволюционном пути, как бы переломный скачок в истории жизни.
Связано это с тем, что возникновение эукариотной клетки впоследствии
обеспечило возможность для усложнения организации живого.
2. Основные концепции происхождения клеток эукариот
2.1. Методологическая основа
аутогенной и симбиотической концепции
К основным концепциям происхождения клеток эукариот относятся
аутогенная и симбиотическая.
Методологическая основа аутогенной концепции основывается
на принципе непрерывности развития (принцип прямой филиации).
Все органеллы возникли из предковой формы путем последовательной
эволюции ее собственных компонентов: поверхностной
мембраны, цитоплазмы, нуклеоида.
Методологический подход симбиотической концепции основывается
на принципе объединения организмов-симбионтов. В процессе
эволюции между симбионтами возрастала интеграция, т. е.
усиливалась связь. Интеграция в процессе эволюции могла стать
такой глубокой, что биоценотические отношения перерастали в физиологические.
Компоненты становились частями нового целостного
организма. Так могла возникнуть полигеномная структура эукариотической
клетки.
2.2. История развития симбиотической концепции
Симбиотическая концепция о происхождении митохондрий была
впервые высказана Р. Альтманом в 1890 г., о происхождении пластид
– А.С. Фаминциным в 1907 г. и К.С. Мережковским в 1909 г.
Б.М. Козо-Полянский в 1924 г. дал ей дарвиновское толкование. Затем
эта концепция была забыта. Это связано с тем, что возможности
световой микроскопии не могли ни подтвердить ее, ни опровергнуть.
К ней вновь возник интерес в 50–60-е гг. ХХ в. в связи с развитием
методов электронно-микроскопических исследований и анализа ДНК.
Было обнаружено сходство строения энергообразующих органелл, их
способность к самостоятельному размножению. ДНК органелл оказалась
сходной с ДНК прокариот.
7
Стр.7
Новый фактический материал привел к возрождению симбиотической
концепции. В наиболее энергичной форме она стала развиваться
Линн Саган Маргелис (1983). Суть концепции заключалась в
следующем:
1) произошел симбиоз крупной анаэробной амебоидной клетки
с мелкими аэробными бактериями, что привело к трансформации
мелких бактерий в митохондрии;
2) симбиоз этой клетки со спирохетоподобными бактериями привел
к появлению: жгутикового аппарата, кинетосом, центросом. Клетки
с этим набором органелл после дифференциации ядра от цитоплазмы
дали начало линии, ведущей к царствам грибов и животных;
3) третий акт симбиоза произошел с цианобактериями (синезелеными
водорослями). Это привело к формированию царства растений.
К началу XXI в. симбиотическая концепция, по сравнению с
аутогенной, приобрела наибольшую популярность. Но у нее имеются
и слабые места.
2.3. Экспериментальное подтверждение возможности
симбиотического происхождения эукариотической клетки
и слабые места этой концепции
Для ее обоснования используют следующие аргументы:
1. Относительная генетическая автономность хлоропластов и
митохондрий. Она проявляется в следующем:
а) имеется собственная генетическая система у органелл;
б) они способны к размножению посредством деления;
в) непрерывность в клеточных циклах;
г) изолированные хлоропласты и митохондрии синтезируют
собственные иРНК и белки.
2. Сходство геномов и белоксинтезирующих систем митохондрий
и хлоропластов с прокариотами. Оно заключается в следующем:
2.1. ДНК органелл проявляет сходство с ДНК прокариотов:
а) их ДНК не связана с гистонами;
б) является кольцевой молекулой;
в) одни и те же антибиотики блокируют репликацию ДНК органелл
и прокариот. В то же время эти вещества не препятствуют
репликации ядерной ДНК эукариот.
2.2. Сходство в строении рибосом:
а) рибосомы хлоропластов и митохондрий сходны с рибосомами
прокариот по константе седиментации (S);
8
Стр.8