Национальный цифровой ресурс Руконт - межотраслевая электронная библиотека (ЭБС) на базе технологии Контекстум (всего произведений: 610073)
Контекстум
Молекулярная генетика, микробиология и вирусология  / №1 2016

ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ BURKHOLDERIA MALLEI НА ОСНОВЕ МЕТОДА АМПЛИФИКАЦИИ ДИФФЕРЕНЦИРУЮЩИХ ФРАГМЕНТОВ ДНК (250,00 руб.)

0   0
Первый авторБондарева
АвторыСавченко С.С., Ткаченко Г.А., Леденева М.Л., Лемасова Л.В., Антонов В.А.
Страниц5
ID399113
АннотацияРазвитие методов генотипирования возбудителя сапа обусловлено его высокой патогенностью, отсутствием эффективных мер профилактики и угрозой использования Burkholderia mallei в качестве биологического оружия. В данной работе предложена схема типирования штаммов возбудителя сапа на основе метода амплификации дифференцирующих фрагментов ДНК (Different Region Analysis, DFR). Выбор вариабельных локусов, дифференциально присутствующих у различных штаммов возбудителя сапа, осуществлен на основе анализа аннотированных полногеномных последовательностей штаммов B. mallei. К 9 выбранным локусам сконструированы праймеры и флуоресцентные зонды, оптимизированы условия амплификации дифференцирующих фрагментов в двух вариантах: с электрофоретической детекцией результатов и с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в формате стрипа. Оценка возможности применения метода DFR для генетической характеристики штаммов выполнена на 14 штаммах B. mallei. Определение генетических профилей исследуемых штаммов возбудителя сапа позволило установить, что разработанная схема DFRтипирования характеризуется высокой дискриминирующей силой (значение индекса Хантера-Гастона составило 0,92), воспроизводимостью, быстротой проведения анализа, легкостью интерпретации и возможностью использования в эпидемиологическом мониторинге за возбудителем сапа.
УДК579.871.1:579.253].083.1
ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ BURKHOLDERIA MALLEI НА ОСНОВЕ МЕТОДА АМПЛИФИКАЦИИ ДИФФЕРЕНЦИРУЮЩИХ ФРАГМЕНТОВ ДНК / О.С. Бондарева [и др.] // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология .— 2016 .— №1 .— С. 35-39 .— URL: https://rucont.ru/efd/399113 (дата обращения: 12.04.2025)

Предпросмотр (выдержки из произведения)

Van embden J., Cave M., Crawford J., Dale J., eisenach K., Gicquel B. et al. strain identification on Mycobacterium tuberculosis by DnA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology. <...> Gibson A., huard r., Gey van Pittius n., lazzarini l., Driscoll J., Kurepina N. et al. <...> Application of sensitive and specific molecular methods to uncover global dissemination of the major rDrio sublineage of the latin American-Mediterranean Mycobacterium tuberculosis spoligotype family. <...> Baranov A., Mariandyshev A., Mannsеker t., Dahle U., Bjune G. Molecular epidemiology and drug resistance of widespread genotypes of Mycobacterium tuberculosis in northwestern russia. <...> Dubiley s., ignatova A., Mukhina t., nizova A., Blagodatskikh s., stepanshina V. et al. <...> Mokrousov i., otten t., Zozio t., turkin e., nazemtseva V., sheremet A. et al. <...> At Baltic crossroads: a molecular snapshot of Mycobacterium tuberculosis population diversity in Kaliningrad, russia. <...> Mokrousov i., otten T., Manicheva O., Potapova y., Vishnevsky B., narvskaya O. et al. <...> ГЕНОТИПИРОВАНИЕ шТАММОВ BuRKHOLDERIA MALLEI НА ОСНОВЕ МЕТОДА АМПЛИфИКАЦИИ ДИффЕРЕНЦИРУюЩИХ фРАГМЕНТОВ ДНК ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора, 400131, Волгоград Развитие методов генотипирования возбудителя сапа обусловлено его высокой патогенностью, отсутствием эффективных мер профилактики и угрозой использования Burkholderia mallei в качестве биологического оружия. <...> В данной работе предложена схема типирования штаммов возбудителя сапа на основе метода амплификации дифференцирующих фрагментов ДНК (Different region Analysis, DFr). <...> Выбор вариабельных локусов, дифференциально присутствующих у различных штаммов возбудителя сапа, осуществлен на основе анализа аннотированных полногеномных последовательностей штаммов B. mallei. <...> Оценка возможности применения метода DFr для генетической характеристики штаммов выполнена на 14 штаммах B. mallei. <...> Drug-resistant tuberculosis, clinical virulence, and the dominance of the Beijing strain family in russia. <...> Microbiol. 2002; 40 (6): 1930–7. 7. narvskaya o., Mokrousov i., otten t., Vishnevsky B. Molecular markers: application <...>